R语言piecewiseSEM结构方程模型在生态环境领域实践技术应用

结构方程模型(Sructural Equation Modeling,SEM)可分析系统内变量间的相互关系,并通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。在R语言结构方程程序包中,piecewiseSEM语法简洁,将结构方程模型拆分为多个组分(component)模型进行拟合和评估,可与混合效应模型实现无缝对接,在应对研究系统中复杂数据结构和类型,如多层数据嵌套和非正态分布类型变量(二项分布、泊松分布),有明显的优势。因而,在生态环境领域得到广泛应用,是该领域颇受欢迎的结构方程模型程序包。本训练营将基于R语言piecewiseSEM程序包,通过理论讲解和实际操作相结合的方式,由浅入深地系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程。我们筛选大量经典案例,这些案例来主流期刊,具有很大的参考和借鉴价值。训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、piecewise包简介及应用案例、非正态分布变量分析、嵌套/分层/多水平数据分析、重复测量和时间数据分析、空间自相关数据分析、系统发育数据分析、复合变量分析、分类变量、非线性数据及数据分组分析。

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专题01 R/Rstudio简介及入门 【提供视频、教材、相关案例数据代码】

(1)R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等

(2)R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等

(3)R语言数据文件读取、整理(清洗)、结果存储等(含 tidverse

(4)R语言基础绘图(含 ggplot ):基本绘图、 排版、发表质量绘图输出存储

专题02 结构方程模型(SEM) 介绍【提供视频、教材、相关案例数据代码】

(1)SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾

(2)SEM的基本结构

(3)SEM的估计方法

(4)SEM的路径规则

(5)SEM路径参数的含义

(6)SEM分析样本量及模型可识别规则

(7)SEM构建基本流程

专题03 piecewise包简介及应用案例

(1)结构方程模型在生态学研究中的应用介绍及要点回顾

(2)piecewiseSEM结构方程模型基本原理

(3)piecewiseS EM 结构方程模型构建应用案例

专题04、piecewiseSEM非正态分布变量分析

(1)非正态分布数据VS非正态分布变量

(2)piecewiseSEM处理非正态变量的注意事项

(3)piecewiseSEM处理二项分布和泊松分布案例

专题05、piecewiseSEM嵌套/分层/多水平数据分析

(1)嵌套/多水平/分层数据概述

(2)piece wiseSEM与混合 / 多水平/分层模型的结合

(3)均衡和不均衡结构嵌套/多水平/分层数据结构方程实例

专题06、piecewiseSEM处理重复测量和时间数据

(1)时间重复测量数据特点简介

(2)时间/重复测量数据的自相关问题

(3)piecewiseSEM处理时间自相关问题实例

专题07、piecewiseSEM处理空间自相关数据

(1)数据空间自相关概述

(2)piecewiseSEM处理空间自相关数据基本原理

(3)piecewiseSEM处理空间自相关问题实例

专题08、piecewiseSEM处理系统发育数据

(1)系统发育相关问题介绍

(2)系统发育相关数据纳入结构方程模型实现途径

(3)piecewiseSEM系统发育相关数据纳入结构方程实例

专题09 piecewiseSEM复合变量(composite)分析

(1)复合变量的定义及在生态学领域应用情景分析

(2)piecewiseSEM复合变量分析实现途径

(3)piecewiseSEM复合变量分析案例

专题10、piecewiseSEM处理分类变量

(1)分类变量介绍

(2)分类变量路径系数含义及表达方式

(3)外生变量为分类变量分析案例

专题11、piecewiseSEM非线性关系数据分析

(1)非线性数据简介

(2)piecewiseSEM处理非线性数据途径及案例

(3)piecewiseSEM处理变量间交互作用关系方式及案例

专题12、piecewiseSEM数据分组(multigroup)分析

(1)分组数据vs分类变量vs交互作用

(2)数据分组分析实现途径

(3)二分组及多分组模型分析及结果表达

(4)分组分析案例

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