在R中安装glmGamPoi包的时候,出现了如下报错:
install.packages('glmGamPoi')
尝试方案一:
sudo apt install pkg-config libhdf5-dev
安装lighdf5-dev,并将安装路径链接至usr/lib/文件。
locate rhdf5filters.so
sudo ln -s /home/xuyang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/rhdf5filters/libs/rhdf5filters.so /usr/lib/rhdf5filters.so
重新安装仍未解决。
尝试方案二:
先安装rhdf5filters,然后安装rhdf5。
BiocManager::install(c("rhdf5filters", "rhdf5"), force = TRUE)
解决了!
之后安装glmGamPoi包成功!