“rhdf5filters.so’ not found when install ‘glmGamPoi‘ package

一个人旅行*-*2023-12-03 18:01

在R中安装glmGamPoi包的时候，出现了如下报错：

复制代码

install.packages('glmGamPoi')

尝试方案一：

复制代码

sudo apt install pkg-config libhdf5-dev

安装lighdf5-dev，并将安装路径链接至usr/lib/文件。

复制代码

locate rhdf5filters.so

复制代码

sudo ln -s /home/xuyang/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.1/rhdf5filters/libs/rhdf5filters.so  /usr/lib/rhdf5filters.so

重新安装仍未解决。

尝试方案二：

先安装rhdf5filters，然后安装rhdf5。

复制代码

BiocManager::install(c("rhdf5filters", "rhdf5"), force = TRUE)

解决了！

之后安装glmGamPoi包成功！