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单细胞
dundunmm
19 天前
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论文阅读之方法: Single-cell transcriptomics of 20 mouse organs creates a Tabula Muris
The Tabula Muris Consortium., Overall coordination., Logistical coordination. et al. Single-cell transcriptomics of 20 mouse organs creates a Tabula Muris. Nature 562, 367–372 (2018).
生信宝典
1 个月前
单细胞
“harmony”整合不同平台的单细胞数据之旅
其实在Seurat v3官方网站的Vignettes中就曾见过该算法,但并没有太多关注,直到看了北大张泽民团队在2019年10月31日发表于Cell的《Landscap and Dynamics of Single Immune Cells in Hepatocellular Carcinoma》,为了同时整合两类数据(包括SMART-seq2和10X)(Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(七)- 导入10X和SmartSeq2数据Tabula Muris),使不同平台的数据可以整合一起进行非监督
让学习成为一种生活方式
1 个月前
单细胞
单细胞转录组学在植物系统和合成生物学中的应用进展-文献精读83
单细胞转录组学在植物系统和合成生物学中的应用进展最佳实践:教程-文献精读80植物是由多种细胞类型组成的复杂系统,其结构呈现出分层的组织形式。为了理解复杂植物系统的分子基础,单细胞RNA测序(scRNA-seq)已成为揭示细胞水平基因表达模式高分辨率以及研究细胞类型异质性的重要工具。此外,对植物生物系统进行scRNA-seq分析具有巨大潜力,可生成新知识以指导植物生物系统设计和合成生物学的发展。合成生物学旨在通过基因组编辑、工程化或基于理性设计的基因组重写,从而对植物进行遗传或表观遗传修饰,以提高作物产量和
亚图跨际
2 个月前
单细胞
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定量分析
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随机动态行为
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化学主方程
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确定性常微分方程
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随机性偏微分方程
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收敛速度
MATLAB生物细胞瞬态滞后随机建模定量分析
在 MATLAB 中,确定性常微分方程(ODE)可以通过多种数值方法进行求解,最常用的是 MATLAB 提供的 ode45、ode23 等函数。这些函数使用不同的数值算法来求解初值问题,并且适用于不同类型的常微分方程。
还是要前进啊
7 个月前
r语言
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单细胞
R语言:单细胞:挑选PC分群聚类
#生成随机颜色 > randomColor <- function() { paste0("#",paste0(sample(c(0:9, letters[1:6]), 6, replace = TRUE),collapse = "")) }
还是要前进啊
7 个月前
r语言
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单细胞
R语言:单细胞pcoa降维和去批次
#生成随机颜色 > randomColor <- function() { paste0("#",paste0(sample(c(0:9, letters[1:6]), 6, replace = TRUE),collapse = "")) }
爱基百客
8 个月前
单细胞
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表观遗传学
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rip-seq
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socs
单细胞+RIP-seq项目文章| Cell Reports&hnRNPU蛋白在小鼠精原干细胞池建立的关键作用
精原干细胞(SSCs)是负责精子发生的干细胞,具有自我更新和分化产生功能性精子的能力。SSCs的持续再生对于维持雄性生育力至关重要。然而,SSC池的发育起源尚不清楚。在哺乳动物中,SSCs源自名为 prospermatogonia(ProSG)的前精原细胞,依次发育为增殖型前精原细胞(M-ProSG)、初级过渡型前精原细胞(T1-ProSG)和次级过渡型前精原细胞(T2-ProSG)三种类型。ProSG的迁移和分化过程对于SSC池的建立至关重要,但这一过程的调控机制仍不完全清楚。
一个人旅行*-*
1 年前
linux
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前端
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单细胞
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glmgampoi
“rhdf5filters.so’ not found when install ‘glmGamPoi‘ package
在R中安装glmGamPoi包的时候,出现了如下报错:尝试方案一:安装lighdf5-dev,并将安装路径链接至usr/lib/文件。