单细胞个性化细胞注释

关于单细胞中级的课程内容,前面已经有了三次直播。欢迎回看~

单细胞直播一理解seurat数据结构与pbmc处理流程

单细胞直播二从GSE104154中理解seurat结构

单细胞直播三seurat数据结构与数据可视化


本期主要内容


本期指哪打哪,自己选定细胞,进而命名呢?达到真正的个性化细胞注释

讨论 为什么会涉及学术不端?

因为个性化亚群命名 水很深。只要你seurat够精通,指定细胞名称轻而易举。但是不希望大家这么搞呢,技术无罪,人有罪。


我认为比较正常的是:亚群命名完成之后,再放回总群,使用umap展示......

结语

个性化亚群命名的问题涉及到数据分析和解释的主观性。尽管使用Seurat等工具可以很容易地对细胞进行分类和命名,但是在命名过程中存在主观因素的介入,可能导致结果的不一致性和不可靠性。所以请理性看待个性化,正常使用个性化方法

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