【文献分享】KCFtools：基于k-mer的无比对基因组变异检测与基因型矩阵构建工具理解和利用遗传多样性对进化生物学和现代作物改良都至关重要。渐渗（introgression）——通过杂交和回交在不同物种或群体之间转移单倍型——在驯化和适应过程中扮演了关键角色，引入了如胁迫耐受性和病害抗性等有益性状。随着染色体级别参考基因组的发展，我们解析大型复杂基因组（如小麦、燕麦）的能力显著提升，大规模群体重测序和泛基因组框架的建立也揭示了与农艺性状相关的结构变异和存在/缺失变异（PAV）。然而，全面利用这些遗传资源来鉴定渐渗和可变区域，需要能够处理大规模、复杂和多样化基因组数据集的计算方法。