【文献分享】abCRISPR:基于深度学习的脱碱基gRNA理性设计框架CRISPR-Cas9系统已成为广泛使用的基因组编辑工具,通过设计一段与靶位点(20 nt)互补的gRNA引导序列,即可轻松编程切割任何DNA序列。然而,一个关键局限始终存在:gRNA与基因组中部分匹配的序列(最多6个错配)也会诱导非预期的脱靶切割,这严重限制了CRISPR在临床和精准研究中的应用。近年来,基于CRISPR RNA在噬菌体感染过程中天然发生的脱碱基氧化可降低脱靶活性的观察,研究者开发了gRNA的脱碱基修饰(OXO)——将gRNA的18-19位(相对于PAM)替换为dSpacer(脱碱基脱氧