DICOM 文件中,VR,VL,SQ,图像二进制的几个注意点

DICOM 文件的结构,在网上有很多的学习资料,这里只介绍些容易混淆的概念,作为回看笔记。

1. 传输语法

每个传输语法,起都是表达的三个概念:大小端、显隐式、压缩算法

DICOM Implicit VR Little Endian: 1.2.840.10008.1.2

DICOM Explicit VR Little Endian: 1.2.840.10008.1.2.1

DICOM Explicit VR Big Endian: 1.2.840.10008.1.2.2

JPEG_LOSSLESS_TRANSFER_SYNTAX: "1.2.840.10008.1.2.4.70";

在dcmtk中,dcmdata工程内dcxfer.cc文件都有明确的标识,例如JPEG_LOSSLESS_TRANSFER_SYNTAX: "1.2.840.10008.1.2.4.70"; 表示

复制代码
{ UID_JPEGProcess14SV1TransferSyntax, // "1.2.840.10008.1.2.4.70"
  "JPEG Lossless, Non-hierarchical, 1st Order Prediction",
  EXS_JPEGProcess14SV1,
  EBO_LittleEndian,
  EVT_Explicit,
  EJE_Encapsulated,
  14L ,14L,
  OFFalse,
  OFFalse,
  ESC_none },

上边就表示了JPEG_LOSSLESS_TRANSFER_SYNTAX这个传输语法,是小端和显式的。

2 显式VR

  • 当VR是OB OW OF UT SQ UT UN的时候,VL占用4个字节
组号 元素号 VR+预留 值长度 数据元素值
2字节 2字节 2字节+2字节(0x00,0x00) 4字节 由数据长度决定
  • 当为其他普通类型的时候,是如下的结构
组号 元素号 VR+预留 值长度 数据元素值
2字节 2字节 2字节 2字节 由数据长度决定
  • 隐式
组号 元素号 值长度 数据元素值
2字节 2字节 4字节 由数据长度决定

3. Sequence二进制文件编码

3.1. 显式长度

当Sequence的数据元素值被编码为32位无符号整数值的时候,这个长度应该包括由该数据元素传递的零个或多个Item产生的总长度。如果项目序列包含零个项目,则此数据元素长度应为00000000H。

以下是一个例子:

因为这个文件是显式小端(边)编码方式,标注1表示组号和元素号,标注2中显示,前两个字节是SQ,接下来2个字节是预留00 00,标注3中,长度是0x18,也就是24个字节长度,这就表示接下来的24个字节都是此Sequence元素。

接下来我们再详细看下Sequence内部item的定义的结构;内部的Item以FFFE,E000开始,然后是4个字节的长度,然后是一个标准的DataSet集合。

上图中,标注1就是Sequence中的Item的开始。

  • 再看另外一个例子2,这个可以大家自己分析一下

3.2 当Sequence中,是未定义的长度,也就是,数据元素长度字段为FFFF,FFFFH的值的时候,此时,它应与序列定界项目结合使用。序列定界项目应位于项目序列的最后一个项目之后,其Item的标签应为(FFFE,E0DD),项目长度为00000000H。

以下是一个西门子CT产生的dicom文件片段,我个人感觉这个文件是错误的。

大家可以看到标注1的位置,表示这个sequence是没有设定长度的,所以,它的结尾是以FFFE,E0DD结束,后边再跟上0000 0000.也就是标注4所指的位置。这里,注意一下,第一个item的长度是四个字节,使用55 00 00 00来表示,换算为十进制就是85个字节,实际上接下来有122个字节,这里我感觉应该是7A 00 00 00。接下来的item都是正常,这里注意,内部也同样包含了一个SQ,内部的SQ的长度也是用FF FF FF FF表示的,这里的第一个item的长度文件内记为10 00 00 00,也就是16个字节,通过观察,确实是16个字节的长度,这样也可以进一步证明,标识2的位置55 00 00 00是错误的。或者,我理解错了,大家一起探讨。

4 文件二进制数据

隐式小端

下面给的一个例子是隐式,小端的例子。可见GroupTag(7FE0)和ElementTag(0010),在实际二进制排列中是e07f 1000的二进制;0x00080000=524288个字节=2Byte512 512

显式,小端

可见GroupTag(7FE0)和ElementTag(0010),VR:OW 缺省两个字节 ,VL: 0X00 08 00 00=524288个字节=2Byte512 512

JpegLossLess 二进制存储方式 小端 显式



相关推荐
用户37215742613520 分钟前
Java 实现 Excel 与 TXT 文本高效互转
java
浮游本尊1 小时前
Java学习第22天 - 云原生与容器化
java
渣哥3 小时前
原来 Java 里线程安全集合有这么多种
java
间彧3 小时前
Spring Boot集成Spring Security完整指南
java
间彧4 小时前
Spring Secutiy基本原理及工作流程
java
Java水解5 小时前
JAVA经典面试题附答案(持续更新版)
java·后端·面试
洛小豆7 小时前
在Java中,Integer.parseInt和Integer.valueOf有什么区别
java·后端·面试
前端小张同学7 小时前
服务器上如何搭建jenkins 服务CI/CD😎😎
java·后端
ytadpole7 小时前
Spring Cloud Gateway:一次不规范 URL 引发的路由转发404问题排查
java·后端
华仔啊7 小时前
基于 RuoYi-Vue 轻松实现单用户登录功能,亲测有效
java·vue.js·后端