R语言【paleobioDB】——pbdb_taxon()：通过名称或标识符，获得一个类群名的基本信息

ALittleHigh2024-01-18 19:25

Package paleobioDB version 0.7.0

paleobioDB 包在2020年已经停止更新，该包依赖PBDB v1 API。

可以选择在Index of /src/contrib/Archive/paleobioDB (r-project.org)下载安装包后，执行本地安装。

Usage

R 复制代码

pbdb_taxon (...)

Arguments

参数【...】：可通过 API 调用的参数。所有可用参数详见 PBDB Data Service: Single taxon。

Value

返回一个数据帧，含有一个类群的基本信息。

Example

R 复制代码

library(paleobioDB)
library(RCurl)

options(RCurlOptions = list(cainfo = system.file("CurlSSL", "cacert.pem", package = "RCurl")))

pbdb_taxon (name="Canis", vocab="pbdb", 
show=c("attr", "app", "size"))




  taxon_no orig_no record_type  rank taxon_name common_name
1    41198   41198       taxon genus      Canis      canine
    attribution     status parent_no reference_no is_extant
1 Linnaeus 1758 belongs to     90655        12782         1
  firstapp_ea firstapp_la lastapp_ea lastapp_la size extant_size
1    30.80000    20.43000    0.01170    0.00000   65          26

Page

R 复制代码

function (...) 
{
    l <- list(...)
    .pbdb_query("taxa/single", query = l)
}