Package paleobioDB version 0.7.0
paleobioDB 包在2020年已经停止更新,该包依赖PBDB v1 API。
可以选择在Index of /src/contrib/Archive/paleobioDB (r-project.org)下载安装包后,执行本地安装。
Usage
R
pbdb_taxa_auto (...)
Arguments
参数【...】:可通过 API 调用的参数。所有可用参数详见 PBDB Data Service: Auto-completion for taxonomic names。
Value
包含匹配项信息(分类单元排名和数据库中出现的次数)的 DataFrame。
Example
R
library(paleobioDB)
library(RCurl)
options(RCurlOptions = list(cainfo = system.file("CurlSSL", "cacert.pem", package = "RCurl")))
pbdb_taxa_auto (name="Cani", limit=10)
oid typ rnk nam noc
1:1 54044 txn 12 Caniformia 5659
1:2 41189 txn 9 Canidae 3441
1:3 41189 txn 9 canid 3441
1:4 90655 txn 8 canine 1365
1:5 90655 txn 8 Caninae 1365
1:6 41198 txn 5 Canis 693
1:7 41198 txn 5 canine 693
1:8 115080 txn 12 Caniniina 581
1:9 5252 txn 5 Caninia 253
2 300804 txn 7 Canini 180
Page
R
function (...)
{
l <- list(...)
.pbdb_query("taxa/auto", query = l)
}