R语言【taxlist】——tax2traits():将分类信息设置为分类单元特征

Package taxlist version 0.2.4


Description

分类法分类可以包含在taxonRelations插槽提供的信息中的 taxlist 对象中。然而,对于统计分析来说,将这些信息插入到插槽taxonTraits中可能更方便。

Usage

R 复制代码
tax2traits(object, ...)

## S3 method for class 'taxlist'
tax2traits(object, get_names = FALSE, ...)

Arguments

参数【object】:一个 taxlist 对象。

参数【...】:在方法之间传递的进一步参数。

参数【get_names】:指示是否应该检索分类单元名称而不是分类单元id的逻辑值。


Details

此函数只能应用于包含父子关系和分类级别信息的对象。


Value

类taxlist的对象,将分类法添加为特征。


Examples

R 复制代码
Acanthaceae <- subset(x = Easplist, subset = TaxonName == "Acanthaceae",
  slot = "names", keep_children = TRUE)
summary(Acanthaceae)
复制代码
object size: 29.9 Kb 
validation of 'taxlist' object: TRUE 

number of taxon usage names: 143 
number of taxon concepts: 113 
trait entries: 9 
number of trait variables: 1 
taxon views: 3 

concepts with parents: 112 
concepts with children: 28 

hierarchical levels: form < variety < subspecies < species < complex < genus < family 
number of concepts in level form: 0
number of concepts in level variety: 2
number of concepts in level subspecies: 3
number of concepts in level species: 84
number of concepts in level complex: 0
number of concepts in level genus: 23
number of concepts in level family: 1
R 复制代码
Acanthaceae <- tax2traits(Acanthaceae, get_names = TRUE)
head(taxon_traits(Acanthaceae))
复制代码
    TaxonConceptID       life_form variety subspecies               species      genus
14              59 obligate_annual    <NA>       <NA>   Asystasia gangetica  Asystasia
15              60 obligate_annual    <NA>       <NA>  Asystasia mysurensis  Asystasia
97             319 obligate_annual    <NA>       <NA> Hygrophila auriculata Hygrophila
108            341    phanerophyte    <NA>       <NA>     Justicia betonica   Justicia
238          50264  climbing_plant    <NA>       <NA>      Thunbergia alata Thunbergia
241          50423    phanerophyte    <NA>       <NA>    Hypoestes aristata  Hypoestes
         family
14  Acanthaceae
15  Acanthaceae
97  Acanthaceae
108 Acanthaceae
238 Acanthaceae
241 Acanthaceae
相关推荐
2401_8454174515 分钟前
set和map
java·开发语言
2301_8210465228 分钟前
Python的深度学习
开发语言·javascript·ecmascript
扯淡的闲人1 小时前
多语言编码Agent解决方案(2)-后端服务实现
开发语言·python·深度学习
烦躁的大鼻嘎2 小时前
【Linux】深入Linux多线程架构与高性能编程
linux·运维·服务器·开发语言·c++·ubuntu
野生的编程萌新2 小时前
【C++深学日志】C++编程利器:缺省参数、函数重载、引用详解
c语言·开发语言·c++
Slaughter信仰2 小时前
深入理解Java虚拟机:JVM高级特性与最佳实践(第3版)第十三章知识点问答(15题)
java·开发语言·jvm
小柯J桑_2 小时前
C++之特殊类设计
java·开发语言·c++
QiZhang | UESTC2 小时前
JAVA算法练习题day11
java·开发语言·python·算法·hot100
bigdata-rookie2 小时前
Java 反射
java·开发语言
能工智人小辰3 小时前
Java8 Swing实现计算器
开发语言