R语言【BIEN】——BIEN_occurrence_species()：从BIEN中提取指定物种的观察数据

ALittleHigh2024-02-23 8:43

Package BIEN version 1.2.6

Description

BIEN_occurrence_species()从BIEN数据库下载特定物种的观察记录。

Usage

R 复制代码

BIEN_occurrence_species(
  species,
  cultivated = FALSE,
  new.world = NULL,
  all.taxonomy = FALSE,
  native.status = FALSE,
  natives.only = TRUE,
  observation.type = FALSE,
  political.boundaries = FALSE,
  collection.info = FALSE,
  only.geovalid = TRUE,
  ...
)

Arguments

参数【species】：一个物种或多个物种。属名和种加词之间应该有一个空格。属名应该首字母大写。

参数【cultivated】：是否返回已知的栽培记录？默认为FALSE。

参数【new.world】：NULL （默认值）返回全球记录，TRUE 只返回新世界中的记录，FALSE 只返回旧世界中的记录。

参数【all.taxonomy】：是否返回所有分类信息？包括原始数据和清理后的数据。

参数【native.status】：是否返回引进状态信息？默认值为FALSE。TURE将会返回引进状态信息。

参数【native.only】：是否排除引进物种？默认为TRUE。

参数【observation.type】：是否返回观察类型信息（即标本或图片）？默认值为FALSE。

参数【collection.info】：是否返回采集和鉴定的信息？默认值为FALSE。

参数【only.geovalid】：是否只返回具有有效坐标的记录？默认值为TRUE。

参数【...】：其他参数。

Value

包含指定物种的观察记录的数据框。

Examples

R 复制代码

BIEN_occurrence_species("Abies amabilis")
species_vector<-c("Abies amabilis", "Acer nigrum")
BIEN_occurrence_species(species_vector)
BIEN_occurrence_species(species_vector,all.taxonomy = TRUE)