日常科研中经常使用的命令

Linux目录树状结构

  1. Windows是磁盘分区,Linux不区分盘符,所有文件都在根目录斜线下面;

  2. 根目录显示不同,Linux是一个斜线,而windows是盘符,然后冒号;

  3. 分割目录Linux用斜线,Windows是反斜线。

为何做生物信息一定要学习Linux?【高效】

常用的Linux命令

  1. 查看当前时间
bash 复制代码
date
  1. 查看日历
bash 复制代码
cal
  1. 显示已登录的用户列表
bash 复制代码
who
  1. 显示当前用户的用户id及所属用户组的信息
bash 复制代码
id

5.显示系统已经运行的时间

bash 复制代码
uptime

6.显示最近用户登录的记录

bash 复制代码
last
  1. 清空当前屏幕
bash 复制代码
clear

(1)在服务器上从查看图片:需要提前在服务器安装ImageMagick软件,本地安装Xming软件,然后使用display命令显示。

ImageMagick -- Convert, Edit, or Compose Digital Imageshttps://imagemagick.org/(2)Xshell自带查看图片显示的功能,属性----->隧道------>转发X11连接到(X)


科研中遇到的命令

【1】统计文件夹下特定类型(eg: *.npz )文件个数

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ls *.npz | wc -l
  1. 处理tsv文件,提取前50列内容并保存成csv文件输出
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cut -f 1-50 data.tsv > extracted_data.csv
  1. 查看tsv的列名并保存
bash 复制代码
head -n 1 data.tsv | awk -F'\t' '{for(i=1;i<=NF;i++) print "Column "i": "$i}'
> mycolumn.log
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