环状 DNA 序列的最小表示法

问题描述

小C正在研究一种环状的 DNA 结构,它由四种碱基ACGT构成。这种环状结构的特点是可以从任何位置开始读取序列,因此一个长度为 n 的碱基序列可以有 n 种不同的表示方式。小C的任务是从这些表示中找到字典序最小的序列,即该序列的"最小表示"。

例如:碱基序列 ATCA 从不同位置读取可能的表示有 ATCA, TCAA, CAAT, AATC,其中 AATC 是字典序最小的表示。

测试样例

样例1:

输入:dna_sequence = "ATCA"

输出:'AATC'

样例2:

输入:dna_sequence = "CGAGTC"

输出:'AGTCCG'

样例3:

输入:dna_sequence = "TTGAC"

输出:'ACTTG'

方法一:枚举法

java 复制代码
public class Main {
    public static String solution(String dna_sequence) {
        // Please write your code here
        int A_num = 0;
        for(char ch : dna_sequence.toCharArray()){
            if(ch == 'A') A_num++;
        }
        if(A_num != 0){
            String res = dna_sequence;
            for(int i = 0;i < A_num;i++){
                int index = dna_sequence.indexOf('A');
                dna_sequence = dna_sequence.substring(index)+dna_sequence.substring(0,index);
                res = MinString(res,dna_sequence);
                if(dna_sequence.charAt(0) == 'A'){
                    dna_sequence = dna_sequence.substring(1) + 'A';
                }
            }
            return res;
        }
        int C_num = 0;
        for(char ch : dna_sequence.toCharArray()){
            if(ch == 'C') C_num++;
        }
        if(C_num != 0){
            String res = dna_sequence;
            for(int i = 0;i < C_num;i++){
                int index = dna_sequence.indexOf('C');
                dna_sequence = dna_sequence.substring(index)+dna_sequence.substring(0,index);
                res = MinString(res,dna_sequence);
                if(dna_sequence.charAt(0) == 'C'){
                    dna_sequence = dna_sequence.substring(1) + 'C';
                }
            }
            return res;
        }
        int G_num = 0;
        for(char ch : dna_sequence.toCharArray()){
            if(ch == 'G') G_num++;
        }
        if(G_num != 0){
            String res = dna_sequence;
            for(int i = 0;i < G_num;i++){
                int index = dna_sequence.indexOf('G');
                dna_sequence = dna_sequence.substring(index)+dna_sequence.substring(0,index);
                res = MinString(res,dna_sequence);
                if(dna_sequence.charAt(0) == 'G'){
                    dna_sequence = dna_sequence.substring(1) + 'G';
                }
            }
            return res;
        }
        return dna_sequence;
    }

    private static String MinString(String res, String dna_sequence) {
        if(res.equals(dna_sequence)) return res;
        for(int i = 0;i < res.length();i++){
            if(res.charAt(i) < dna_sequence.charAt(i)){
                return res;
            }
            if(res.charAt(i) > dna_sequence.charAt(i)){
                return dna_sequence;
            }
        }
        return res;
    }

    public static void main(String[] args) {
        // You can add more test cases here
        System.out.println(solution("ATCA").equals("AATC"));
        System.out.println(solution("CGAGTC").equals("AGTCCG"));
        System.out.println(solution("TCATGGAGTGCTCCTGGAGGCTGAGTCCATCTCCAGTAG").equals("AGGCTGAGTCCATCTCCAGTAGTCATGGAGTGCTCCTGG"));
    }
}
相关推荐
2401_857636396 分钟前
Spring Boot环境下的知识分类与检索
java·spring boot·后端
阑梦清川7 分钟前
数学建模启发式算法篇(一)---遗传算法
算法·数学建模·启发式算法
小趴菜不能喝10 分钟前
spring boot 3.x 整合Swagger3
java·spring boot·swagger
ErvinHowell20 分钟前
文件MD5生成性能大提升!如何实现分片与Worker优化
前端·vue.js·算法
用户405478783748222 分钟前
深度学习笔记 - Pytorch自搭建VGG-16模型实现人脸识别
算法
微服务技术分享22 分钟前
专为成长型企业打造的Java CRM系统源码:CRM客户关系管理系统技术解析与功能构建
java·crm客户关系管理系统源码·鸿鹄crm客户关系管理系统·鸿鹄crm客户关系管理系统源码
琪露诺大湿23 分钟前
JavaEE-多线程初阶(4)
java·开发语言·jvm·java-ee·基础·1024程序员节·原神
Java程序员-小白31 分钟前
Spring Shell——快速构建终端应用,自定义终端命令
java·后端·spring
益达爱喝芬达35 分钟前
力扣11.3
算法·leetcode
y_m_h35 分钟前
leetcode912.排序数组的题解
数据结构·算法