R语言装环境Gcc报错以及scater包的安装

一穷二白到年薪百万2025-01-11 19:15

error: 'timespec_get' has not been declared in '::' 80 | using ::timespec_get;

在conda 的虚拟环境中升级gcc的版本

python 复制代码

conda install -c conda-forge gcc=11 gxx=11

终极方法，在R的最新版本和环境下装啥都能成功！！

比如beyondcell的方法的Beyondcell Score Normalization中 scater包的安装

在R的环境下比如R4.3.3 Seurat以及Seuratobj版本都是5.0，不知道为啥在4.0版本死活装不上，

安装步骤如下：

python 复制代码

install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("BiocStyle")
devtools::install_github("alanocallaghan/scater")
# 完美安装成功