3D 坐标下边际直方图是一种将三维数据分布与其一维边际分布同时展示的可视化图形。主图部分为三维直方图，用于展示变量 X、Y、Z 之间的联合分布情况；在其底部的两个平面上，分别附加了 X 方向与 Y 方向的边际直方图，用以反映各变量在单独维度上的分布特征。
主要可用于：
（1）分析三种不同基因的表达量（X, Y, Z）在不同样本中的分布，寻找具有相似表达模式的样本簇。
（2）显示粒子在三维空间中的位置分布（X, Y, Z），边际直方图可以分别看出粒子在X方向、Y方向和Z方向上的位置偏好。
（3）筛选候选化合物，X轴=化合物与靶标的亲和力，Y轴=化合物溶解度，Z轴=化合物毒性。理想的化合物会集中在"高亲和力、高溶解度、低毒性"的角落。边际直方图可以快速显示大部分化合物在单个维度上的分布。
本期教程使用Origin绘制3D坐标下边际直方图。
1.导入数据，数据格式为变量 X、Y、Z 之间的关系，其中Z是散点分布数据；
2.选中Z列，点击绘图---点击3D---选择3D散点图，
3.绘制出来的图形如下图所示；双击图形，打开绘图细节对话框。在左侧，展开绘图树目录，清除原始选项，选择XY 投影，点选确定按钮。
4.回到表格中，计算X、Y的频数分布；选中X列，点击统计---描述统计---频数分布---打开对话框；
在跳出的对话框下，将指定区间范围依据为区间中心，要计算的量选择区间中心和频数即可。同样地，对Y列进行同样地操作；
5.分别对表格进行整理，分别添加一列，分别为3D散点图中Y轴最大值40和X轴最小值6；
6.回到图形中，点击图---图表绘制，在跳出的对话框中，设置可用数据为在当前文件夹中的工作表，然后在顶部面板选择Fule Economy FreqCounts1工作表。 在中间面板选择绘图类型为3D 条状图，然后设区间中心为X，添加列为Y，计数为Z，然后点击添加按钮。同样地，在顶部面板选择Fule Economy FreqCounts2工作表。 在中间面板选择绘图类型为3D 条状图，然后设添加列为X，区间中心为Y，计数为Z，然后点击添加按钮。
7.双击柱状图，打开绘图细节对话框。 对于X， 在轮廓选项卡，设置X方向条形宽度为60， 且Y方向条形宽度为0。 对于Y， 在轮廓选项卡，设置X方向条形宽度为0， 且X方向条形宽度为60。点击确认。
8.双击Z轴，重新对刻度范围进行调整；
9.对图形进行其他细节美化，包括字体格式，坐标轴标题，图例等，其最终效果图如下图所示：
以上就是Origin绘制3D坐标下边际直方图，大家根据以上步骤即可绘制出来。快去试试吧！
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