用freesurfer跑预处理的时候,nu_correct这步报错:

大概意思就是生成的mnc文件有问题
gpt说是因为FreeSurfer 自带 MINC 没被正确使用
系统里有别的 minc / netcdf 库
PATH 冲突
或没有正确 source FreeSurfer
让我用which检查
which mri_nu_correct.mni
which mincinfo
结果发现第二个出来的路径并不在freesurfer下面,而是被之前安装的civet覆盖了
所以每次其实要激活一下freesurfer的路径
export FREESURFER_HOME=/path/to/freesurfer
source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh
这样之后就可以了