传统蛋白、配体（药物）可视化需要反复切换软件、手工标注界面残基、调整视角参数。现在，使用插件后，仅需导入PDB对接文件，将自动构建互作位点与对接图，用动态色彩编码结合能，并以分子探针高亮氢键网络与疏水口袋。
（1）演示PDB数据库中已经对接好的蛋白与配体（药物）PDB文件。后续出对接自己的蛋白与配体文章。
https://www.rcsb.org/structure/6A04
（2）用pymol打开下载好的PDB文件
（3）在pymol中安装插件
（4）选择文件夹
（5）选择cpi的python脚本文件
（6）输入：cpi 6a04
（7）自动计算蛋白与小分子作用的氨基酸位点
（8）放大、旋转至合适视角
（9）拖动结合位点至合适视角
（10）导出结果
（11）清除标签
（12）清除位点
（13）展示3D
（14）结果及导出
（15）将导出的结果放入ppt
这里仅供操作参考，具体图形美化可根据需要自行调整，比如字体大小、旋转方向等等。