WES:全外显子测序技术服务

服务介绍

外显子组(Exome)占人类全基因组的1%~2%,但却涵盖约85%的致病基因变异。全外显子测序(Whole-exome sequencing,WES)是通过探针杂交捕获技术富集全基因组外显子区域的DNA后,进行深度测序与分析获取基因编码区变异信息的高通量测序技术。相比全基因组测序(WGS),WES具备测序深度更高(≥100×)、成本更低、检出更多低频变异等优势。WES广泛用于遗传突变研究、肿瘤研究(如肿瘤新抗原)等领域。

技术流程

服务优势

  1. 采用高效Exome探针和优化的杂交捕获体系,捕获效率更高、均一性更优异;

  2. 高深度测序,覆盖度更高;测序成本远低于WGS;

  3. 精准检测多类型基因变异,包括SNV、CNV、InDel。

技术应用

  1. 遗传病诊断:检测罕见病或遗传性疾病相关基因突变,助力精准诊断;

  2. 肿瘤研究:识别癌症驱动基因突变,如肿瘤体细胞突变、新抗原检测、遗传易感基因等研究;

  3. 个性化医疗:分析个体基因变异,为药物选择和治疗方案提供依据。

送样要求

注:具体送样要求请详询

分析内容

图1. gDNA样本实测表现。与其它品牌相比捕获效率更高、均一性更优

图2. 左图:均一性指标达到了1.24;右图:捕获效率高于其它品牌,达到93.7%

图3. 本服务使用试剂盒在不同测序平台上的性能指标表现。分别在NovaSeq6000和DNBSEQ-T7进行测序(30 μL、15 μL杂交体积)

图4. EPI-WES杂交体系在不同Panel中的数据表现。获得的文库投入750 ng进行捕获,采用不同大小Panel进行捕获(illumina PE150)

图5. 杂交体系快杂2 h实测结果。捕获效率和均一性指标稳,可大幅提升检测效率,缩短实验周期

图6. 针对肿瘤不同大小Panel实测结果

应用案例

1.Mol Cancer:TACC2缺失降低软组织肉瘤中CCL3和CCL4的表达并减弱抗PD-1治疗反应(DOI:10.1186/s12943-025-02354-2)

这项研究揭示了TACC2作为软组织肉瘤(STS)中的肿瘤抑制因子,通过调节CCL3和CCL4趋化因子的表达来增强抗肿瘤免疫反应。研究发现TACC2高表达与更好的免疫细胞浸润和抗PD-1治疗效果相关。研究中,WES被用于鉴定STS患者样本中TACC2相关的基因组改变,特别是CNV;分析不同STS亚型中TACC2的基因变异情况等。

图7. TACC2基因拷贝数变异的分析结果

2.Nat Genet:蛋白基因组学揭示早发型子宫内膜癌特征及生育保留治疗预测因子(DOI: 10.1038/s41588-024-01703-z)

该研究通过多组学分析揭示了早发型子宫内膜样子宫内膜癌(EEEC)的分子特征,特别关注40岁以下患者的生育保留治疗反应预测。研究发现特定的暴露组相关突变特征与EEEC相关,并鉴定了可预测孕激素治疗反应的生物标志物。文章对215名EEEC患者进行WES,鉴定EEEC与LEEC(晚发型)之间的突变差异;根据TCGA分类系统对样本进行POLE、MSI、CNL和CNH分子分型;识别与年龄和环境因素相关的突变特征。

图8. 229名TJFD研究中EEC患者的遗传特征和相关的临床病理特征

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