植物无法像动物一样移动，却能在复杂多变的环境中顽强生长、精准发育并灵活应对胁迫，关键就在于它们拥有一套精密的细胞间通讯网络。从种子萌发、器官分化到开花结实，从抵御病虫害到耐受干旱、盐碱与极端温度，植物体内无时无刻不在进行着短距离与长距离的信号传递，让不同细胞、组织和器官"步调一致"。
这些信号的"信使"形式丰富多样：
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植物激素（生长素、细胞分裂素、脱落酸、乙烯、油菜素甾醇等）作为系统性信号，通过维管组织实现整株水平的长距离调控，统筹生长节奏与胁迫响应；
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小肽信号（信号肽）是植物体内的"局部指令"，常在细胞间短距离传递，精细调控细胞分化、器官形态建成与免疫反应；
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可移动小RNA、mRNA则通过胞间连丝或韧皮部在细胞与器官间穿梭，在表观遗传与基因表达层面远程调控发育与抗逆。
无论哪种信号，都离不开一个核心环节------配体-受体互作。胞外的信号分子（配体）被细胞膜表面的受体（如类受体激酶RLK、类受体蛋白RLP）精准识别、结合，将胞外信号转化为胞内信号，进而激活下游通路，最终改变细胞命运与功能。可以说，配体-受体互作是植物细胞通讯的"分子开关"与"第一道闸门"，在协调细胞功能、维持生长发育稳态、启动环境响应中发挥着不可替代的作用。
近年来，随着单细胞转录组、空间转录组技术在植物研究中的普及，解析组织内不同细胞类型间的信号交流、构建细胞间通讯网络已成为前沿热点。然而，植物配体-受体互作数据分散、注释不全、覆盖物种有限、缺乏专门的数据库与分析工具，极大限制了相关研究的深入。为填补这一空白，福建农林大学团队开发了PlantCellChatDB------一个专门针对植物的配体-受体互作数据库与分析平台，聚焦受体互作蛋白与胞外信号分子（激素、小肽、代谢物等）的系统性注释与互作分析，为植物单细胞/空间转录组的细胞通讯研究提供了一站式解决方案。
除了传统的蛋白-蛋白配对，数据库还新增了**Signaling molecule（小分子信号，如激素），多亚基受体复合物，共受体/辅助受体（帮助受体识别配体），激动剂（增强信号传导），****拮抗剂（抑制信号传导）**等模块，这个设计让数据库比传统"单配体-单受体"模型更贴近真实的生理过程。这也是这个数据库最关键的创新点之一。
PlantCellChatDB的设计逻辑与分析全流程
【数据库介绍】
**一 **物种：拟南芥、水稻、番茄、玉米、大豆
二 可下载的配受体信息
Interaction_name：互作名称
Signal：信号名称；这条互作属于哪个信号通路/信号分子
Ligand：配体；胞外信号分子，也就是"发送信号的一方"
Receptor：受体；细胞膜上接收信号的蛋白，"接收信号的一方"
Complex1/Complex2：受体复合物亚基；当受体是多亚基复合物时，这里放其他亚基
Agonist：激动剂；增强配体-受体互作的分子
Antagonist：拮抗剂；抑制配体-受体互作的分子
CoAreceptor/CoIreceptor：共受体/辅助受体；帮助主受体结合配体的辅助蛋白
Evidence：证据来源；文献PMID，告诉你这条互作是哪篇文章验证的
Interaction_type：互作类型。分两大类：
（1）Signaling molecule（小分子信号-受体）
小分子信号主要分为：ABA，BR，Ca2+，chitin，CTK，elf18，ET，flg22，GA，IAA，JA，K+，Mg2+，NO3-，SA。
（2）Interacting protein（蛋白-蛋白互作）
三 在线搜索配受体信息
四 cell communication测试结果可视化
**同时支持单细胞转录组数据和空间转录组数据。**主要展示UMAP、不同signal细胞群互作的网络图、特定细胞群L-R互作强度柱状图，以及组间差异对比柱状图。
五 数据库技术文档
【实测展示】
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数据集：GSE123013
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物种：拟南芥
一 细胞注释
**二 **cell-cell communication结果解读
- （1）通讯表格
Interaction_name：配受体对信息，Ligand-Receptor。
Signal：此配受体对归属的信号通路。表格示例为ABA通路，代表此配受体对（如AT3G11410_AT5G46790）为ABA通路内的细胞通讯。
Source：配体来源细胞类型。
Target：受体来源细胞类型。。
Prob：Probability。互作打分值（CellChat 算法计算的通讯概率）。
数值越大：该组【源细胞→靶细胞+配受体配对】的细胞通讯可信度/作用强度越高。
Pvalue：显著性检验。
- （2）细胞间通信网络图
通过线条方向（箭头）和粗细描述细胞间的信号流向和强度。
- （3）不同信号下细胞间检测到的显著配体-受体对统计柱状图
【爱基百客植物单细胞项目经验】
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| 物种 | 组织部位 |
| 烟草，拟南芥，水稻，玉米，棉花，香蕉，橡胶，康乃馨，油菜，杨树，兰科，猕猴桃，牡丹，大豆等 | 根，花药，顶芽，果肉，花瓣，花柱，茎尖，胚珠，叶片，幼穗，种子，韧皮部，花粉等 |
实测数据
