GIS 坐标系主要分为地理坐标系（GCS） 和投影坐标系（PCS） 两大类，前者用经纬度描述球面位置，后者将曲面展平为平面直角坐标以便量测。
- 地理坐标系 (GCS) ：基于椭球体模型，使用经度、纬度（单位：度）定义位置。适用于全球定位、数据存储及交换。
- 投影坐标系 (PCS) ：基于数学投影方法，将地理坐标转换为X、Y平面坐标（单位：米）。适用于地图制图、距离和面积计算。
常用地理坐标系 (GCS)
| 简称 | 全称/基准 | 特点与应用场景 | EPSG 代码 |
|---|---|---|---|
| WGS84 | World Geodetic System 1984 | 全球通用标准，GPS/北斗原始数据、谷歌地球、国际遥感影像默认基准。 | 4326 |
| CGCS2000 | 2000 国家大地坐标系 | 中国法定基准，地心坐标系，与 WGS84 差异极小，用于国土、测绘、新工程。 | 4490 |
| GCJ02 | 火星坐标系 | 中国加密坐标，在 WGS84 基础上非线性偏移，高德、腾讯等国内互联网地图使用。 | 无标准 |
| BD09 | 百度坐标系 | 百度专属加密，在 GCJ02 基础上二次偏移，仅用于百度地图生态。 | 无标准 |
| Beijing 54 | 1954 北京坐标系 | 旧参心坐标系，基于克拉索夫斯基椭球，已淘汰，仅见于历史图纸。 | 4214 |
| Xian 80 | 1980 西安坐标系 | 旧参心坐标系，逐步被 CGCS2000 替代，见于部分老工程数据。 | 4610 |
常用投影坐标系 (PCS)
| 简称 | 投影方式 | 特点与应用场景 | EPSG 示例 |
|---|---|---|---|
| Web Mercator | 伪墨卡托投影 | Web 地图标配（如谷歌、OpenLayers），全球不分带，高纬度变形大，单位"伪米"。 | 3857 |
| UTM | 通用横轴墨卡托 | 国际通用，60 个经度带（每带 6°），适合中低纬度大比例尺地形图、无人机航测。 | 326xx (北半球) |
| Gauss-Krüger | 高斯 - 克吕格投影 | 中国工程主流，3°带或 6°带分带投影，变形小，用于市政、道路、1:1 万等大比例尺测绘。 | 45xx (CGCS2000 3°带) |
| Lambert | 兰勃特等角圆锥 | 适合中纬度东西延伸区域，常用于中国全图或省级挂图。 | 4479 |
| Albers | 阿尔伯斯等面积圆锥 | 保持面积不变形，适合人口、资源统计专题图。 | 4480 |
在中国境内公开使用的地理信息必须使用GCJ02 或BD09等加密坐标系，这是国家规定了，所有的商用地图必须对坐标进行加密处理。