第二，应保证CPU能最有效的完成计算机的逻辑控制。为确保计算机的兼容性，即计算机能够尽可能完成指令，那么对于一些特殊的问题指令就应该进行区分，大致可分为两类，特定指令和通用指令。前者必须以某种方式进行存储，后者则用计算机确定的指令完成操作。执行通用指令的部分，构成了计算机第二个特定的部分：CC。
第三，任何要执行冗长又复杂操作的设备，必须具备相当大的存储空间，至少在以下四个操作阶段，是需要内存存储的：
（1）在进行加减乘除的操作过程中，存在一些必须被记录的中间结果。特别是对于更为复杂的计算操作而言。
（2）对于执行复杂操作的指令，可能会需要相当大的内存存储空间，特别是指令是根据问题需求所构建的，那么这些内容必须被存储。
（3）在许多问题中，特定的函数表达式有着十分重要的作用，而这些函数表达式通常会以表格的形式给出。而事实上，在某些情况下，这些函数表达式是根据经验得出的，在另外的情况下，函数表达式则是由解析式得到的，即使如此，从表格中获取它们，比重新需要一个值来进行重新计算更方便也更快捷。
（4）对于偏微分方程，初始条件和边界条件可能会构成大量的数据，而这些数据在给定的问题中，必须被存储下来。
（5）对于双曲或抛物线类型的偏微分方程，计算得到的中间结果必须被存储，以便于后续计算。这些中间结果的产生，不是由人为操作产生的，而是计算机本身在计算过程中自动生成的。
（6）对于总微分方程也适用，但它们需要的存储空间偏小，更多依赖于问题所给出的常数和固定参数等，至于进一步的存储空间需求，则根据需求来进行确定。
（7）排序问题和某些统计实验也需要存储中间结果和最终结果。
总结第三点，计算机需要相当大的存储空间，虽然这些存储的各个部分的内容在性质上略有不同、目的也大相径庭，但是这些内容构成了一个完整的组织。并且人们尽可能地希望这些内容是可以互相替换地。无论如何，存储空间构成了计算机的第三个特定部分：M。
三个特定部分CA、CC和M可对应于人类神经系统中的联想神经元。至于感觉神经元、传入神经元、运动神经元和传出神经元等的对应物，则是计算机的输入和输出设备。现在我们会对它们进行简要的讨论。
尽管计算机的特定部分CC和特定部分M之间的所有信息传输，都通过中间部分所包含的机制来实现，但信息仍然需要出外部设备输入，并将最终结果输出到外部设备中。这里的外部设备指的输入和输出设备，可以由人们直接感知。
计算机必须具备某种特定类型的介质来保持输入和输出的能力。该介质在计算机中被称为外部记录介质：R。
第四，计算机必须有组织将信息从外部记录介质R传输到特定部分CC和特定部分M。这些组织形成了计算机的输入，即特定部分：I。最好是从R，通过I到M的转移，而不是直接到CC。（R→M）
第五，计算机必须有组织将信息从特定部分CC和特定部分M传输到外部记录介质R。这些组织形成了计算机的输出，即特定部分：O。同样最好是从M，通过O到R的转移，而不是直接从CC。（M→R）
当然，输入到R的信息是计算机的最终结果，最终结果信息必须与中间结果信息区分开来，中间信息的结果仍然存在于M中。一个重要的问题出现了：R除了具有直接接近人类行为和知觉的属性外，R还具备记忆的属性。事实上，R是计算机自动并长期存储各种问题信息的天然媒介，那么，为什么有必要在计算机中使用M呢？M具备的存储功能，难道不能由R接管吗？
将算术运算时产生的信息移出设备，即从M到R是很方便的。然而，逻辑指令可以从外部感知，即从R可以感知到I。后者可以在设备生成时由O传递到R，并在需要时由I从R感知。在许多情况下，使用M加速了运算，但将M和R混合使用是可行的，而不会严重损失速度，并增加处理信息的容量。