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8 天前
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Python单细胞分析-基于leiden算法的降维聚类
基于上一次的降维文件,我们可以查看一下其降维质量如何:在这里我们选择了四个指标用于生成可视化图像。umap图1
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17 天前
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bulk RNA-Seq (4)合并表达矩阵
、脚本用法:输入:每个样本的定量结果输出:reads count 矩阵:genes.counts.matrix #原始矩阵
生信大表哥
21 天前
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基于多组学谱的疾病亚型分型与样本分类
许多疾病(尤其是癌症)具有高度的异质性,这是因为不同患者之间的癌症进展存在显著差异。此外,环境、生活方式等多种其他因素也可能在疾病异质性中发挥作用。因此,识别疾病的潜在亚型或将样本划分到已知的亚组中,对于理解疾病的病因学并为不同亚型患者确定合适的干预措施至关重要。目前已有多种工具可利用样本的多组学数据来识别疾病亚型,或根据多组学谱将样本分类到不同的亚组。本节将讨论那些有助于基于潜在分子模式理解样本分组的工具。
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