空间转录组

基于GeoMx DSP空间多组学技术的癌症研究进展GeoMx® Digital Spatial Profiler（DSP）作为空间生物学领域的重要技术之一，推动了空间多组学研究的发展进程，并在临床转化中展现出广泛应用前景。该技术能够满足肿瘤学、肿瘤免疫、传染病、免疫性疾病、神经科学、发育生物学及药物研发等多个领域在不同研究阶段的实际需求。本文通过四篇高分研究文章，聚焦DSP空间多组学技术在癌症研究中的具体应用，以期为相关领域的研究提供参考。

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2月《Science》也开始用单细胞核空转平台了文章《Mucosal vaccination in mice provides protection from diverse respiratory threats》（小鼠黏膜疫苗接种可提供针对多种呼吸道威胁的保护），该文献发表于杂志《Science》，2026 年，影响因子为 45.8。

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空间转录组NMF降维分群非负矩阵分解(NMF)非负矩阵分解是一种降维技术，它将一个矩阵 V 分解为两个非负矩阵 W 和 H：V≈W×H

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纯生信挖掘+6个样WB，发表IF=10文章一、写在前面最近发现一篇“有点意思”的文章，来自北京大学口腔医学院、国家口腔医学中心的作者挖掘整合分析了多个GEO数据的微阵列、Bulk RNA-seq通过四种机器学习算法筛选了159个核心DEGs后通过GEO中的scRNA-seq、空转数据挖掘进一步确定SASH1的细胞与空间定位情况，补了六个样本的细胞系WB实验后，就水灵灵的在25年12月发在了《INTERNATIONAL JOURNAL OF SURGERY》这一IF=10.1的期刊上。

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用R语言画生信基地圣诞树~生信基地圣诞树~MERRY CHRISTMAS写在前面祝大家圣诞节快乐！Merry Christmas！愿大家在这冬日里邂逅所有美好与惊喜，科研顺利，文章多多~

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空间转录组|多样本整合分析手册在空间转录组（Spatial Transcriptomics, ST）研究中，批次效应（Batch Effect）是一个核心挑战。当多个样本（来自不同个体、实验室或处理批次）被独立测序时，由于实验条件、试剂差异或组织处理方式的不同，可能会引入非生物学性的表达水平变异。

我是有底线的