scanpy单细胞转录组python教程(二):单样本数据分析之数据质控接上节(scanpy单细胞转录组python教程(一):不同形式数据读取)。scanpy流程和R seurat流程并无太多差别,只是语言变了而已,思维不变。读取完矩阵,那么质控无非就是对于UMI、features、线粒体基因、核糖体基因比例、双细胞等等的检测而已。这里我们演示的数据是之前R里面演示过的数据。这里仅仅分析单个样本,不涉及到数据合并,去批次等等,主要是为了熟悉scanpy流程和代码,实际情况可能你不止一个样本,多样本数据分析我们后续讲到。学会基础,后面的也不再话下!