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蜡笔小新..
8 天前
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ScanPy - Preprocessing and clustering 3k PBMCs (legacy workflow)工作复现
话不多说先上官网:由于之前已经对Seurat中的10x Genomics数据集的教程进行了复现,所以这篇文档只是参考官方教程来进行撰写的,会加入自己的理解以及教程中没有涉及到的扩展的内容,本文的代码会使用大模型来添加注释,每段代码都会加注释方便学习和理解。
纪伊路上盛名在
1 个月前
数据结构
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可视化
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生物学
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scRNA-seq scanpy教程1:准备工作+AnnData数据结构理解
此处使用python版本的scRNA-seq处理工具scanpy,而不是R版本的seurat,因为seurat包安装繁杂