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scanpy

蜡笔小新..
2 个月前
python·seurat·scanpy
ScanPy - Preprocessing and clustering 3k PBMCs (legacy workflow)工作复现话不多说先上官网:由于之前已经对Seurat中的10x Genomics数据集的教程进行了复现,所以这篇文档只是参考官方教程来进行撰写的,会加入自己的理解以及教程中没有涉及到的扩展的内容,本文的代码会使用大模型来添加注释,每段代码都会加注释方便学习和理解。
纪伊路上盛名在
3 个月前
数据结构·python·可视化·生物学·单细胞·scanpy
scRNA-seq scanpy教程1:准备工作+AnnData数据结构理解此处使用python版本的scRNA-seq处理工具scanpy,而不是R版本的seurat,因为seurat包安装繁杂