多组学

青春不败 177-3266-052011 天前
开发语言·python·生物信息·多组学·高通量测序
python语言生物信息多组学大数据深度挖掘与论文整理技巧生物信息广泛涵盖基因组学、蛋白组学、系统生物学、表观遗传、非编码等前沿领域以及药物设 计、基因工程等应用领域。
Bioinfo Guy19 天前
大语言模型·单细胞·多组学·队列研究
开源scRNA Tools 2.|利用 BayesPrism 剔除微环境背景并识别肿瘤亚克隆特征BayesPrism(Bayesian cell Proportion Reconstruction Inferred using Statistical Marginalization)是一款基于全贝叶斯推断的R包,专为解析**肿瘤微环境(TME)的复杂性而设计。该工具旨在通过统计边缘化方法,利用单细胞RNA-seq(scRNA-seq)数据作为先验参考,从大量RNA-seq(bulk RNA-seq)**样本中联合估计细胞类型的组成比例以及特定细胞类型的基因表达谱。
Bioinfo Guy4 个月前
人工智能·大语言模型·多组学
Genome Med|RAG-HPO做表型注释:学习一下大语言模型怎么作为发文思路今天给大家介绍一篇做工具的文章,教大家怎么去模仿这种思路产出自己的文章,结合大语言模型去写工具也是可以出文章的,不论是集成化的docker本地部署,或者缩减点做个shiny,甚至是开放源代码都是可以的。
dundunmm5 个月前
论文阅读·人工智能·embedding·生物信息·单细胞·多组学·细胞类型识别
【论文阅读】SIMBA: single-cell embedding along with features(2)代码地址:https://github.com/pinellolab/simba当前大多数单细胞分析流程仅限于细胞嵌入,并且严重依赖聚类方法,而缺乏显式建模不同特征类型之间相互作用的能力。此外,这些方法往往针对特定任务进行定制,因为不同的单细胞问题通常以不同方式被提出。
dundunmm5 个月前
论文阅读·深度学习·神经网络·embedding·生物信息·单细胞·多组学
【论文阅读】SIMBA: single-cell embedding along with features(1)代码地址:https://github.com/pinellolab/simba当前大多数单细胞分析流程仅限于细胞嵌入,并且严重依赖聚类方法,而缺乏显式建模不同特征类型之间相互作用的能力。此外,这些方法往往针对特定任务进行定制,因为不同的单细胞问题通常以不同方式被提出。
我是有底线的