python语言生物信息多组学大数据深度挖掘与论文整理技巧

生物信息广泛涵盖基因组学、蛋白组学、系统生物学、表观遗传、非编码等前沿领域以及药物设 计、基因工程等应用领域。

一:Python生物信息经典案例解析与编程

1、python语言在生物信息学中的应用

2、python语言特点

3、常见的生物信息数据类型及如何与python语言结合

4、Python生物信息使用场景介绍以及经典案例实操演示 (fasta序列的合并; 序列长度的批量计算; 特定序列的提取;文本处理和格式整理;重测序结果vcf的操作;转录组差异基因结果的筛选;多物种基因家族信息的提取和统计;特定基因集合注释的批量添加......)

5、生物信息大数据分析思路

6、相关书籍与资料推荐

7、自学编程经验分享

二:Python语法与案例操作

1、Python的安装及使用

2、Python在linux系统的运行

3、Python程序的运行

4、DOS、Unix命令行操作基本命令

5、Python变量定义、数字及基本运算

6、字符串实例脚本编写(DNA序列的操作)

三:Python语法与经典实例操作

1、列表

2、元组

3、字典

4、排序

5、分位数

6、异常处理

7、经典实例脚本编写 (基因名称与序列的存储、操作)

四:Python语言数据处理技巧与经典实例操作

1、函数、异常处理、

2、正则表达式

3、高通量测序技术类型及组学数据整合技巧

4、经典实例脚本编写 (正则表达式的匹配操作)

五:Python语言编写循环与经典实例操作

1、Python 编写循环

2、二代测序数据挖掘、与python的结合

3、测序数据获得序列号

4、经典实例脚本编写 (循环操作)

六:Python语言处理文件及论文写作技巧

1、文件读取与输出

2、如何使SCI论文更具科学性

3、(如何写作、摘要、Introduction、Results、Discussion如何写作才可以使审稿人眼前 一亮)

4、经典实例脚本编写 (文件操作)

七:Python 经典生物信息学数据处理实例

经典生物信息学数据操作实例巩固练习 (部分基因序列从数据库中的提取、基因注释信息的添加、基因启动子序列的提取、数据的排序、数据格式的转换、批量数据的操作。。。。。)

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