cell2location jupyter python界面

BayraktarLab/cell2location: Comprehensive mapping of tissue cell architecture via integrated single cell and spatial transcriptomics (cell2location model) (github.com)

cpp 复制代码
conda create -y -n cell2loc_env python=3.9

conda activate cell2loc_env
pip install cell2location -i douban.com
Finally, to use this environment in jupyter notebook, add jupyter kernel for this environment:

conda activate cell2loc_env

conda install -c bioconda -c conda-forge ipykernel
cpp 复制代码
python -m ipykernel install --user --name=cell2loc_env --display-name='Environment (cell2loc_env)'

scanpy教程:空间转录组数据分析-腾讯云开发者社区-腾讯云 (tencent.com)

scanpy_07_spatial (nbisweden.github.io)https://nbisweden.github.io/workshop-scRNAseq/labs/compiled/scanpy/scanpy_07_spatial.html

相关推荐
Yan-英杰44 分钟前
百度搜索和文心智能体接入DeepSeek满血版——AI搜索的新纪元
图像处理·人工智能·python·深度学习·deepseek
weixin_307779132 小时前
Azure上基于OpenAI GPT-4模型验证行政区域数据的设计方案
数据仓库·python·云计算·aws
玩电脑的辣条哥3 小时前
Python如何播放本地音乐并在web页面播放
开发语言·前端·python
taoqick3 小时前
对PosWiseFFN的改进: MoE、PKM、UltraMem
人工智能·pytorch·深度学习
多想和从前一样5 小时前
Django 创建表时 “__str__ ”方法的使用
后端·python·django
charles_vaez6 小时前
开源模型应用落地-LangGraph101-探索 LangGraph 短期记忆
深度学习·语言模型·自然语言处理
WHATEVER_LEO7 小时前
【每日论文】Latent Radiance Fields with 3D-aware 2D Representations
人工智能·深度学习·神经网络·机器学习·计算机视觉·自然语言处理
小喵要摸鱼7 小时前
【Pytorch 库】自定义数据集相关的类
pytorch·python
bdawn7 小时前
深度集成DeepSeek大模型:WebSocket流式聊天实现
python·websocket·openai·api·实时聊天·deepseek大模型·流式输出
Jackson@ML7 小时前
Python数据可视化简介
开发语言·python·数据可视化