K均值聚类方法是一种划分聚类方法,它是将数据分成互不相交的K类。K均值法先指定聚类数,目标是使每个数据到数据点所属聚类中心的总距离变异平方和最小,规定聚类中心时则是以该类数据点的平均值作为聚类中心。
01K均值法原理与步骤
对于有N个数据的数据集,我们想把它们聚成K类,开始需要指定K个聚类中心,假设第i类有ni个样本数据,计算每个数据点分别到聚类中心的距离平方和,距离这里直接用的欧式距离,还有什么海明距离、街道距离、余弦相似度什么的其实都可以,这里聚类的话,欧式距离就好。
(1)、所有类别样本数等于总样本数,即每个类类是互不相同的
(2)、每一类(假设是第i类)中数据点到聚类中心距离平方总和di为:
xi表示第i类各点平均值(聚类中心)
(3)、K类数据点距离之和为:
这样就会有一个KN的距离平方和矩阵,每一列(比如第j列)的最小值对应的行数(比如第i行)就表明:第j个数据样本属于第i类别。这样,每个数据就会分别属于不同的类别了。
比如,表格中红色部分数据点x2到第一类的聚类中心距离最小,则x2就属于第一类。
K均值步骤:
- 随机选取K个数据点作为(起始)聚类中心;
- 按照距离最近原则分配数据点到对应类;
- 计算每类的数据点平均值(新的聚类中心);
- 计算数据点到聚类中心总距离;
- 如果与上一次相比总距离下降,聚类中心替换;
- 直到总距离不再下降或者达到指定计算次数。
其实,这个过程相对比较简单,给我一组聚类中心,总能根据到聚类中心距离最小原则生成一组聚类方案,然后计算各个类别到聚类中心距离总和是否下降,如果距离总和下降,就继续计算每类数据点平均值(新的聚类中心),对应的聚类方案要好(还是那句话:给我一组聚类中心,总能根据到聚类中心距离最小原则生成一组聚类方案),然后不断计算,直到距离总和下降幅度很小(几乎收敛),或者达到指定计算次数。
K-means算法缺点主要是:
- 对异常值敏感;
- 需要提前确定k值;
- 结果不稳定;
02 K均值算法Python的实现
思路:
- 首先用random模块产生随机聚类中心;
- 用numpy包简化运算;
- 写了一个函数实现一个中心对应一种聚类方案;
- 不断迭代;
- matplotlib包结果可视化。
代码如下:
python
1. import numpy as np
2. import random as rd
3. import matplotlib.pyplot as plt
4. import math
5. #数据
6. dat = np.array([[14,22,15,20,30,18,32,13,23,20,21,22,23,24,35,18],
7. [15,28,18,30,35,20,30,15,25,23,24,25,26,27,30,16]])
8. print(dat)
9. #聚类中心#
10. n = len(dat[0])
11. N = len(dat)n
12. k = 3
13. #-------随机产生-----#
14. center = rd.sample(range(n),k)
15. center = np.array([dat.T[i] for i in center])
16. print('初始聚类中心为:')
17. print(center)
18. print('-----------------------')
19.
20. #计算聚类中心
21. def cent(x):
22. return(sum(x)/len(x))
23.
24. #计算各点到聚类中心的距离之和
25. def dist(x):
26. #聚类中心
27. m0 = cent(x)
28. dis = sum(sum((x-m0)2))
29. return(dis)
30.
31. #距离
32. def f(center):
33. c0 = []
34. c1 = []
35. c2 = []
36. D = np.arange(k*n).reshape(k,n)
37. d0 = center[0]-dat.T
38. d1 = center[1]-dat.T
39. d2 = center[2]-dat.T
40. d = np.array([d0,d1,d2])
41. for i in range(k):
42. D[i] = sum((d[i]2).T)
43. for i in range(n):
44. ind = D.T[i].argmin()
45. if(ind 0):
46. c0.append(i)#分配类别
47. else:
48. if(ind 1):
49. c1.append(i)
50. else:
51. c2.append(i)
52. C0 = np.array([dat.T[i] for i in c0])
53. C1 = np.array([dat.T[i] for i in c1])
54. C2 = np.array([dat.T[i] for i in c2])
55. C = [C0,C1,C2]
56. print([c0,c1,c2])
57. s = 0
58. for i in C:
59. s+=dist(i)
60. return(s,C)
61.
62. n_max = 50
63. #初始距离和
64. print('第1次计算!')
65. dd,C = f(center)
66. print('距离和为'+str(dd))
67. print('第2次计算!')
68. center = [cent(i) for i in C]
69. Dd,C = f(center)
70. print('距离和为'+str(Dd))
71. K = 3
72.
73. while(K<n_max):
74. #两次差值很小并且计算了一定次数
75. if(math.sqrt(dd-Dd)<1 and K>20):
76. break;
77. print('第'+str(K)+'次计算!')
78. dd = Dd
79. print('距离和为'+str(dd))
80. #当前聚类中心
81. center = [cent(i) for i in C]
82. Dd,C = f(center)
83. K+=1
84.
85.
86. #---聚类结果可视化部分---#
87.
88. j = 0
89. for i in C:
90. if(j 0):
91. plt.plot(i.T[0],i.T[1],'ro')
92. if(j 1):
93. plt.plot(i.T[0],i.T[1],'b+')
94. if(j == 2):
95. plt.plot(i.T[0],i.T[1],'g*')
96. j+=1
97.
98. plt.show()
(1):聚类成功的例子:
对于不合适的初始随机聚类中心,一般而言不会失败,成功次数较多。
可以看出,其实第五次就收敛了,共分成了三类。它们的标签序号为:
第一类:[1, 3, 8, 9, 10, 11, 12, 13];
第二类:[4, 6, 14];
第三类:[0, 2, 5, 7, 15]
聚类图:
聚类结果与实际情况一致
(2):聚类失败的例子:
有时候可能会失败,运行实验了三次出现了一次败笔,迭代过程如下:
散点图:
聚类失败图
显然,由于初始点的随机选取不当,导致聚类严重失真!这聚类效果明显就很差,表明随机产生的初始聚类中心应该不合适,最后不管怎么迭代,都不可能生成合适的聚类了,这与k-means算法的原理确实可以解释的。这就是k-means的最显著的缺点!
03K均值算法的R语言实现
用的还是上面程序一样的数据,R语言聚类就很方便,直接调用kmeans(data,聚类数)就能方便完成:
* rm(list = ls())
* path <- 'C:\Users\26015\Desktop\clu.txt'
* dat <- read.csv(path,header = FALSE)
* dat <- t(dat)
* kc <- kmeans(dat,3)
* summary(kc)
* kc
查看聚类结果:
* K-means clustering with 3 clusters of sizes 8, 3, 5
*
* Cluster means:
* [,1] [,2]
* 1 21.87500 26.00000
* 2 32.33333 31.66667
* 3 15.60000 16.80000
聚成3类,分别有8,3,5个数据
Clustering vector:
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9
3 1 3 1 2 3 2 3 1
V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16
1 1 1 1 1 2 3
第一类:2,4,9,10,11,12,13,14
第二类:1,3,6,8,16;
第三类:5,7,15
由于Python下标是从"0"开始,所以两种方法聚类结果实际上是一样 的**!**