R语言【taxlist】——merge_taxa()：整合概念和移除名称

Package taxlist version 0.2.4

Description

将分类概念合并为单个 taxlist 对象。

Usage

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merge_taxa(object, ...)

## S3 method for class 'taxlist'
merge_taxa(object, concepts, level, print_output = FALSE, ...)

Arguments

参数【object】：taxlist 对象。

参数【...】：要传递给其他方法或从其他方法传递的其他参数。

参数【concepts】：数值（整数）向量，包括要合并的分类概念。

参数【level】：字符向量，指示合并的最低级别。

参数【print_output】：指示是否应在控制台中显示合并概念的逻辑值。

Details

参数【concepts】中指示的分类概念将合并为一个概念。

新概念继承了 slots taxonRelations 和 taxonTraits 的 ID 和相应的属性，这些属性来自参数【concepts】中指示的第一个分类概念。

为方便起见，可以通过设置 print_output=TRUE 来显示生成的概念，但仅在使用参数【concepts】时显示。

此函数的另一种应用是通过参数级别实现的，其中所有较低等级的分类单元都将合并到指定的级别或更高级别（如果合并分类群的父级处于较高级别）。

Value

一个 taxlist 对象。

Examples

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summary(Easplist, c(206, 197))

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concept ID: 206 
view ID: 1 
level: species 
parent: 54853 Cyperus L. 

# accepted name: 
206 Cyperus papyrus L. 

# synonyms (2): 
52612 Cyperus papyrus ssp. antiquorum (Willd.) Chiov. 
52613 Cyperus papyrus ssp. nyassicus Chiov. 
------------------------------ 
concept ID: 197 
view ID: 1 
level: species 
parent: 54853 Cyperus L. 

# accepted name: 
197 Cyperus dives Delile 

# synonyms (5): 
52000 Cyperus immensus C.B. Clarke 
52600 Cyperus exaltatus var. dives (Delile) C.B. Clarke 
52601 Cyperus alopecuroides var. dives Boeckeler 
52602 Cyperus immensus var. petherickii (C.B. Clarke) Kük. 
52603 Cyperus petherickii C.B. Clarke 
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sp_list <- merge_taxa(object = Easplist, concepts = c(206, 197),
    print_output = TRUE)

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concept ID: 206 
view ID: 1 
level: species 
parent: 54853 Cyperus L. 

# accepted name: 
206 Cyperus papyrus L. 

# synonyms (8): 
197 Cyperus dives Delile 
52000 Cyperus immensus C.B. Clarke 
52600 Cyperus exaltatus var. dives (Delile) C.B. Clarke 
52601 Cyperus alopecuroides var. dives Boeckeler 
52602 Cyperus immensus var. petherickii (C.B. Clarke) Kük. 
52603 Cyperus petherickii C.B. Clarke 
52612 Cyperus papyrus ssp. antiquorum (Willd.) Chiov. 
52613 Cyperus papyrus ssp. nyassicus Chiov. 
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