20241218_segmentation

参考:

  1. 使用SA模型 https://ai.meta.com/research/publications/segment-anything/
  2. 讲解生物学意义 https://www.nature.com/articles/s41593-024-01714-3#Sec13

x.0 workflow

  1. 图像分割方法识别出重要的ROI区域
  2. 计算ROI区域个数(需要计算机算法,参考论文OpenCV可以做到)
  3. 用交并比知识计算两个ROI区域的重合度,大于一定值则算叠加态

x.1 使用 segmentation anything 尝试解决

网址https://segment-anything.com/demo meta自带方式解决,


问题:红色图像信噪比很差很难分割出来;绿色图像背景信噪比较高;

解决方案:增加阈值法;高斯滤波;背景扣除;形态性滤波;

x.2 优化

  1. 使用聚类

识别数量1,不佳;

  1. 使用otsu阈值法,形态性去除背景法

彩色识别的区域数量明显上升,但是仍然有很多需要黑色的地方未识别出来。


信噪比好的图片不做处理效果也很好;

x.3 改进方法

可能原因:

查阅论文 https://ai.meta.com/research/publications/segment-anything/ 虽然训练数据集高达1 billion,但是缺少医学相关数据,且对色彩饱和度照片效果好,对信噪比较差的如生物成像效果差;

改进方法:

  1. 增加标注工作制作专用数据集
  2. 寻找更多的数据处理方法,如增加信噪比优化的方法
  3. 实验过程中增加信噪比(最立竿见影的方法),如曝光时间
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