第01章 07 MySQL+VTK C++示例代码,实现医学影像数据的IO数据库存储

要实现将医学影像数据(如DICOM文件或其他医学图像格式)存储到MySQL数据库中,并使用VTK进行数据读取和处理的C++示例代码,可以按照以下步骤进行。这个示例将展示如何将DICOM图像数据存储到MySQL数据库,然后使用VTK读取并显示这些数据。

1. 环境准备

确保你已经安装了以下工具和库:

  • MySQL数据库
  • MySQL Connector/C++(用于连接MySQL数据库)
  • VTK库(用于医学影像数据的读取和处理)
  • CMake(用于构建项目)

2. 创建MySQL数据库和表

首先,创建一个MySQL数据库和表来存储医学影像数据。假设我们要存储DICOM图像的二进制数据及其相关信息。

CREATE DATABASE MedicalImages;

USE MedicalImages;

CREATE TABLE DicomImages (
    ID INT AUTO_INCREMENT PRIMARY KEY,
    PatientName VARCHAR(255),
    StudyDate DATE,
    ImageData LONGBLOB
);

3. C++示例代码

以下是一个完整的C++示例代码,展示了如何将DICOM图像存储到MySQL数据库中,并使用VTK读取和显示这些图像。

cpp 复制代码
#include <iostream>
#include <mysql_driver.h>
#include <mysql_connection.h>
#include <cppconn/statement.h>
#include <cppconn/prepared_statement.h>
#include <cppconn/exception.h>
#include <vtkDICOMImageReader.h>
#include <vtkImageViewer2.h>
#include <vtkRenderWindow.h>
#include <vtkRenderWindowInteractor.h>
#include <vtkRenderer.h>
#include <vtkSmartPointer.h>
#include <fstream>

void StoreDicomInDatabase(const std::string& dicomFilePath, const std::string& patientName, const std::string& studyDate) {
    try {
        sql::mysql::MySQL_Driver* driver;
        sql::Connection* con;
        sql::PreparedStatement* pstmt;

        // Create a connection
        driver = sql::mysql::get_mysql_driver_instance();
        con = driver->connect("tcp://127.0.0.1:3306", "username", "password");

        // Connect to the database
        con->setSchema("MedicalImages");

        // Read the DICOM file into a binary blob
        std::ifstream dicomFile(dicomFilePath, std::ios::binary);
        std::vector<char> buffer((std::istreambuf_iterator<char>(dicomFile)), std::istreambuf_iterator<char>());

        // Prepare the SQL statement
        pstmt = con->prepareStatement("INSERT INTO DicomImages (PatientName, StudyDate, ImageData) VALUES (?, ?, ?)");
        pstmt->setString(1, patientName);
        pstmt->setString(2, studyDate);
        pstmt->setBlob(3, new sql::SQLString(buffer.data(), buffer.size()));

        // Execute the query
        pstmt->executeUpdate();

        std::cout << "DICOM image stored successfully!" << std::endl;

        delete pstmt;
        delete con;
    } catch (sql::SQLException& e) {
        std::cerr << "MySQL Error: " << e.what() << std::endl;
    }
}

void ReadDicomFromDatabaseAndDisplay() {
    try {
        sql::mysql::MySQL_Driver* driver;
        sql::Connection* con;
        sql::Statement* stmt;
        sql::ResultSet* res;

        // Create a connection
        driver = sql::mysql::get_mysql_driver_instance();
        con = driver->connect("tcp://127.0.0.1:3306", "username", "password");

        // Connect to the database
        con->setSchema("MedicalImages");

        // Retrieve the first DICOM image from the database
        stmt = con->createStatement();
        res = stmt->executeQuery("SELECT ImageData FROM DicomImages LIMIT 1");

        if (res->next()) {
            // Get the blob data
            std::istream* blobStream = res->getBlob(1);
            std::vector<char> buffer((std::istreambuf_iterator<char>(*blobStream)), std::istreambuf_iterator<char>());

            // Write the blob data to a temporary file
            std::ofstream tempFile("temp.dcm", std::ios::binary);
            tempFile.write(buffer.data(), buffer.size());
            tempFile.close();

            // Use VTK to read the DICOM file
            vtkSmartPointer<vtkDICOMImageReader> reader = vtkSmartPointer<vtkDICOMImageReader>::New();
            reader->SetFileName("temp.dcm");
            reader->Update();

            // Visualize the image
            vtkSmartPointer<vtkImageViewer2> imageViewer = vtkSmartPointer<vtkImageViewer2>::New();
            imageViewer->SetInputConnection(reader->GetOutputPort());

            vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor> renderWindowInteractor = vtkSmartPointer<vtkRenderWindowInteractor>::New();
            imageViewer->SetupInteractor(renderWindowInteractor);
            imageViewer->Render();
            imageViewer->GetRenderer()->ResetCamera();
            imageViewer->Render();

            renderWindowInteractor->Start();
        } else {
            std::cout << "No DICOM image found in the database." << std::endl;
        }

        delete res;
        delete stmt;
        delete con;
    } catch (sql::SQLException& e) {
        std::cerr << "MySQL Error: " << e.what() << std::endl;
    }
}

int main() {
    // Store a DICOM image in the database
    StoreDicomInDatabase("path/to/your/dicom/file.dcm", "John Doe", "2025-01-01");

    // Read and display the DICOM image from the database
    ReadDicomFromDatabaseAndDisplay();

    return 0;
}

4. 代码解释

  • StoreDicomInDatabase: 这个函数将DICOM文件读取为二进制数据,并将其存储到MySQL数据库中。
  • ReadDicomFromDatabaseAndDisplay: 这个函数从数据库中读取DICOM图像的二进制数据,将其写入临时文件,然后使用VTK读取并显示图像。

5. 编译和运行

确保你已经安装了MySQL Connector和VTK库,并使用CMake来构建项目。CMakeLists.txt文件可以如下配置:

cmake_minimum_required(VERSION 3.10)
project(MySQLVTKExample)

set(CMAKE_CXX_STANDARD 11)

find_package(VTK REQUIRED)
find_package(MySQL REQUIRED)

include(${VTK_USE_FILE})

add_executable(MySQLVTKExample main.cpp)

target_link_libraries(MySQLVTKExample ${VTK_LIBRARIES} ${MYSQL_LIBRARIES})

6. 运行程序

在编译成功后,运行生成的可执行文件,程序将会:

  1. 将DICOM文件存储到MySQL数据库中。
  2. 从数据库中读取DICOM文件并显示。

7. 注意事项

  • 确保DICOM文件路径和MySQL数据库连接信息正确。
  • 由于DICOM图像数据可能非常大,存储和读取时需要注意内存管理。
  • 在实际应用中,可能需要对DICOM文件进行进一步的处理和分析。

通过这个示例,你可以将医学影像数据存储到MySQL数据库中,并使用VTK进行读取和显示。

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