MMP-9(20-469) His Tag 蛋白:高活性可溶性催化结构域的研究工具

一、 概述:MMP-9的功能与研究截短体设计

基质金属蛋白酶-9(MMP-9,明胶酶B)是锌离子依赖的内肽酶家族成员,能够酶解细胞外基质(ECM)中的IV型胶原、明胶等多种底物。其在组织重塑、伤口愈合、炎症反应及肿瘤侵袭转移等生理与病理过程中发挥核心作用。全长MMP-9(92 kDa)包含前肽、催化结构域、纤连蛋白样结构域和血红蛋白样结构域,结构复杂且易形成多聚体,为体外生化研究带来挑战。

MMP-9(20-469) His Tag 重组蛋白是经工程化设计的截短体。它保留了催化活性所必需的全部结构域,并通过去除N端信号肽和前肽(第1-19位氨基酸),同时在第469位后截断,移除了C端的血红蛋白样结构域。该设计旨在获得高表达量、高可溶性、易于纯化且具备组成型活性的催化核心单元,是研究MMP-9酶学特性、筛选抑制剂及探索其病理功能的理想标准化工具。

二、 分子构建、表达与表征

分子设计:

核心序列:覆盖人源MMP-9成熟蛋白的第20至469位氨基酸,包含完整的催化结构域及三个纤连蛋白样结构域。此设计模拟了经体内激活后的MMP-9活性形式。

活性状态:前肽的去除使其无需体外酶切激活即具备基础催化活性。催化中心的关键锌离子结合位点(His401, His405, His411)及底物结合口袋均保持完整。

标签系统:通常在C端或N端融合6x组氨酸标签(6xHis Tag),用于标准化的固定化金属亲和层析纯化,并通过抗His抗体进行便捷的Western Blot检测或固定化。

表达与纯化:

表达系统:主要在大肠杆菌(E. coli)或昆虫细胞-杆状病毒系统中表达。大肠杆菌系统产量高、成本低;昆虫细胞系统则能进行更复杂的翻译后折叠,蛋白溶解性和稳定性通常更优。

纯化策略:采用固定化金属亲和层析(IMAC)作为主要步骤。利用His标签与镍柱结合,经洗涤后,用含咪唑的缓冲液进行梯度洗脱。随后通过分子筛层析去除聚集体,获得高均一性的单体蛋白。纯化全程需在缓冲液中加入Ca²⁺(稳定结构)和Zn²⁺(维持活性)。

三、 核心应用领域

酶动力学与机理研究:

活性测定:使用荧光底物(如DNP-Pro-Leu-Gly-Leu-Trp-Ala-D-Arg-NH₂)或明胶降解实验,直接测定蛋白的酶解动力学参数(Km,kcat),评估其催化效率。

结构-功能关系研究:通过定点突变该蛋白,研究特定氨基酸残基对底物特异性、金属离子结合或抑制剂敏感性的影响。

抑制剂筛选与药物开发:

高通量筛选(HTS):该蛋白是建立基于微孔板的MMP-9抑制剂筛选平台的理想靶标。可快速评估小分子库或天然产物提取物的抑制效力,计算半数抑制浓度(IC50)。

抑制剂作用机制研究:结合酶动力学分析(竞争性、非竞争性抑制模式判断)及生物物理技术(如SPR/BLI),研究候选抑制剂与活性中心的结合亲和力(Ki)和动力学。

蛋白相互作用研究:

作为配体或分析物:利用其His标签,将其固定于生物传感器或磁珠表面,用于研究MMP-9与组织抑制剂(TIMPs)、细胞表面受体(如CD44)或ECM成分的特异性相互作用。

抗体与诊断试剂开发:

免疫原与检测标准品:作为高纯度的抗原,用于制备和筛选针对MMP-9催化结构域的特异性抗体。也可作为标准品,用于定量检测生物样品中MMP-9含量的ELISA试剂盒的建立与校准。

四、 产品优势与实验注意事项

产品优势:

高比活性:由于去除了前肽的自抑制结构域,蛋白通常表现出比全长酶原更高的基础活性,对刺激更敏感。

可溶性与稳定性:截短设计改善了在大肠杆菌中的可溶性表达,且更不易形成非活性多聚体,稳定性更好。

操作通用性:His标签简化了纯化、检测和固定化流程,兼容多种下游应用平台。

关键注意事项:

活性维持:必须在含有1-10 mM CaCl₂的缓冲液中操作和储存,以防止蛋白自降解。严禁使用金属离子螯合剂(如EDTA、EGTA),因其会剥夺活性中心的Zn²⁺导致不可逆失活。

储存条件:建议在含25-50%甘油的缓冲液中,于-80°C分装保存,避免反复冻融。

活性验证:每批次的蛋白在使用前应通过标准荧光底物实验验证其比活性,确保数据可比性。

潜在糖基化差异:若使用大肠杆菌表达系统,所得蛋白无糖基化修饰,其分子量(约55 kDa)和部分物化性质可能与哺乳动物来源的天然MMP-9存在差异,在解释某些特定生物学背景下的结果时需考虑此因素。

五、 总结

MMP-9(20-469) His Tag 重组蛋白是一个经过优化设计的、功能集中的研究工具。它成功地将复杂的MMP-9生物学功能,浓缩于其核心的催化模块之中,为研究人员提供了:

标准化的酶学探针:用于精确解析MMP-9的催化机制、底物谱和调控方式。

高效的药物发现靶标:用于加速针对肿瘤转移、炎症等疾病相关MMP-9活性的抑制剂筛选与优化。

可定量的互作分析单元:用于研究MMP-9在蛋白网络中的相互作用。

该工具极大地便利了MMP-9在基础生物化学、病理学及转化医学领域的研究,是推动该领域从分子机制理解走向治疗性干预的关键试剂之一。

MMP-9(20-469) His Tag 蛋白:高活性可溶性催化结构域的研究工具-南京优爱(UA BIO), 重组蛋白专家

声明:本篇文章在创作中部分采用了人工智能辅助。如有任何内容涉及版权或知识产权问题,敬请告知,我们承诺将在第一时间核实并撤下。

相关推荐
阿正的梦工坊2 小时前
Kronecker积详解
人工智能·深度学习·机器学习
Rui_Freely2 小时前
Vins-Fusion之ROS2(节点创建、订阅者、发布者)(一)
人工智能·计算机视觉
快降重2 小时前
投稿前的“精准体检”:自查查重,如何选择可靠的第三方工具?
人工智能·aigc·写作·降重·查重·降ai
麦麦大数据2 小时前
F067 中医养生知识图谱健康问答系统+膳食食疗系统
人工智能·知识图谱·问答·养生·膳食·食疗
Dfreedom.2 小时前
从 model(x) 到__call__:解密深度学习框架的设计基石
人工智能·pytorch·python·深度学习·call
熬夜敲代码的小N2 小时前
AI for Science技术解析:从方法论到前沿应用的全视角洞察
人工智能
Tadas-Gao2 小时前
AI是否存在“系统一”与“系统二”?——从认知科学到深度学习架构的跨学科解读
人工智能·架构·系统架构·大模型·llm
小李子不吃李子2 小时前
人工智能与创新第一章练习题
人工智能
汤姆yu3 小时前
基于深度学习的水稻病虫害检测系统
人工智能·深度学习