deeploc 2.1 大批量蛋白亚细胞定位分析,适合三代测序级数据、真菌全菌数据的分析

当前可用可以给真核生物(真菌、植物蛋白、动物蛋白等)做大批量亚细胞定位分析的工具主要有两个:

1)deeploc 2.1 (最新版),有在线的,销量数据可以自己搞定;大量数据的,几乎不可能;

2)ProtComp V9.0,也有在线的,但是对国内IP不太友好;大量数据的,难度比deeploc更大;

好在,deeploc 2.1,可以本地部署,只是比较消耗时间和脑细胞;

该软件的本地部署,

1)GPU模式:默认需要单机具备 GPU (>12 GB),同时cpu不小于32 GB,这样就可以自己批量分析了;

2)如果没有GPU的话,也可以选用cup模式,但 cpu 模式下,内存需要大于 48 GB 方能稳定运行;然而,cpu 某事下的分析速率是远低于GPU的

【偷摸的测试了一下,低配的gpu版,速率大约是cpu基础版的5-6倍】;

-----------------------------------------------------------------仅供参考;

相关推荐
神筆&『馬良』3 小时前
Foundation_pose在自己的物体上复现指南:实现任意物体6D位姿检测(利用realsense_D435i和iphone_16pro手机)
目标检测·ubuntu·机器人·视觉检测
liuniu08185 小时前
VMware虚拟机安装ubuntu2022
ubuntu·ros
xfddlm6 小时前
边缘计算_ubuntu环境下使用瑞芯微RK3576NPU推理LLM
人工智能·ubuntu·边缘计算
EHagSJVNpTY6 小时前
MATLAB 中基于最大重叠离散小波变换的心电信号处理探索
ubuntu
.小墨迹7 小时前
apollo学习之借道超车的速度规划
linux·c++·学习·算法·ubuntu
技术路上的探险家8 小时前
Ubuntu下Docker与NVIDIA Container Toolkit完整安装教程(含国内源适配)
linux·ubuntu·docker
无证驾驶梁嗖嗖9 小时前
用Plex打造随身私人影院告别影音杂乱,必须加上cpolar突破地域限制!
ubuntu
Sheep Shaun9 小时前
揭开Linux的隐藏约定:你的第一个文件描述符为什么是3?
linux·服务器·ubuntu·文件系统·缓冲区
生活很暖很治愈10 小时前
Linux——环境变量PATH
linux·ubuntu
予枫的编程笔记11 小时前
【Linux入门篇】Ubuntu和CentOS包管理不一样?apt与yum对比实操,看完再也不混淆
linux·人工智能·ubuntu·centos·linux包管理·linux新手教程·rpm离线安装