deeploc 2.1 大批量蛋白亚细胞定位分析,适合三代测序级数据、真菌全菌数据的分析

当前可用可以给真核生物(真菌、植物蛋白、动物蛋白等)做大批量亚细胞定位分析的工具主要有两个:

1)deeploc 2.1 (最新版),有在线的,销量数据可以自己搞定;大量数据的,几乎不可能;

2)ProtComp V9.0,也有在线的,但是对国内IP不太友好;大量数据的,难度比deeploc更大;

好在,deeploc 2.1,可以本地部署,只是比较消耗时间和脑细胞;

该软件的本地部署,

1)GPU模式:默认需要单机具备 GPU (>12 GB),同时cpu不小于32 GB,这样就可以自己批量分析了;

2)如果没有GPU的话,也可以选用cup模式,但 cpu 模式下,内存需要大于 48 GB 方能稳定运行;然而,cpu 某事下的分析速率是远低于GPU的

【偷摸的测试了一下,低配的gpu版,速率大约是cpu基础版的5-6倍】;

-----------------------------------------------------------------仅供参考;

相关推荐
xiaobobo33301 天前
ubuntu中使用trash工具替代rm防止无法回复
ubuntu·垃圾回收
H Journey1 天前
VMware + Linux(Ubuntu) + 桥接网络知识梳理
linux·网络·ubuntu
hjjdebug1 天前
ubuntu系统 usbmouse 驱动代码分析
linux·ubuntu·usbmouse
神秘剑客_CN1 天前
ubuntu26.04音频转srt字幕
ubuntu·conda·whisperx
windawdaysss1 天前
使用VMware Workstation Pro安装Ubuntu虚拟机教程
linux·运维·ubuntu
xiaobobo33301 天前
ubuntu14.04搭建Samba服务器实现文件共享
ubuntu·samba·共享文件夹
LN花开富贵2 天前
Ubuntu aarch64 架构安装 NoMachine 远程控制 避坑与实战
linux·运维·笔记·学习·ubuntu·嵌入式
取经蜗牛2 天前
Windows 11 WSL + Ubuntu 24.04 安装指南
linux·windows·ubuntu
bush42 天前
linux开发板连接virtualbox虚拟机ubuntu的usb网卡,访问外网方法。
linux·运维·ubuntu
大明者省2 天前
完整 Ubuntu 服务器 XFCE 桌面 + XRDP 远程桌面 部署使用全流程
运维·服务器·ubuntu