R语言使用trajeR包进行组轨迹模型分析(gbtm- group based trajectory models)

GBTM是一种纵向数据分析方法,基于以下核心假设:

虽然所有个体的变化看起来很复杂,但这些变化可以被归纳为几种主要的轨迹模式:

1.纵向聚类 将具有相似发展轨迹的个体归入同一轨迹组

2.有限混合模型 通过轨迹组来近似未知的个体发展路径

3.轨迹识别 识别不同亚群体的变化模式(如递增、递减、稳定等)

在既往文章中,咱们已经介绍了多个能实现轨迹分析的R包,今天我问了一下ai,我写的scitable包竟然也在上面了,吃了一惊

今天来介绍一个trajeR包如何实现组轨迹模型分析,它的名字和traj包非常相似,感觉应该是个辅助增强包,下面我来演示一下,先导入数据

r 复制代码
library(trajeR)
setwd("E:/公众号文章2026年/trajeR包做轨迹分析")
dataNORM01<-read.csv("data.csv")
data <- as.matrix(data)

这是个简单的数据,y这里是你研究的变量y1-y5有五个变量,t1-t5是时间数据,使用trajeR包做组轨迹分析非常简单,就是一句话代码

r 复制代码
sol <- trajeR(Y = data[, 2:6], A = data[, 7:11], degre = c(2, 2), Model = "CNORM", Method = "EM")

Y这里放入感兴趣变量,A这里进入时间,degre这里是二次项,Method的默认方法是"EM"

生成模型后可以进一步绘图

r 复制代码
plotrajeR(sol)

本数据是分成了2个类别,其他指标计算

后验概率

r 复制代码
AvePP(sol, Y = data[, 2:6], A = data[, 7:11])   #后验概率

计算每个数据值的成员概率

r 复制代码
GroupProb(sol, Y = data[, 2:6], A = data[, 7:11])  #计算每个数据值的成员概率

计算正确分类的几率

r 复制代码
OCC(sol, Y = data[, 2:6], A = data[, 7:11])  #计算正确分类的几率

也可以一次性计算多个结果

r 复制代码
adequacy(sol, Y = data[, 2:6], A = data[, 7:11])  #计算五种方法的总结:分配比例、平均后验概率、置信区间、正确分类几率。

本期结束。

相关推荐
OxYGC38 分钟前
[工程] PHP2Shell 漏洞解析:两条 PHP 内核 RCE,为什么应用层的防护全部失效
android·开发语言·php
小徐不徐说41 分钟前
数据库存储基础:理解表结构、主键、事务与 BLOB
开发语言·数据库·c++·qt·程序设计
草莓熊Lotso1 小时前
【C++ 基于微服务的即时通讯系统】网关基建:cpp-httplib 与 WebSocketpp 从入门到实战
linux·开发语言·数据库·c++·redis·微服务·云原生
李纲明1 小时前
WordPress 媒体库上传失败或一直转圈:先核 PHP 上传限制与目录权限,再查安全插件与对象存储
运维·开发语言·安全·php·wordpress·媒体库·devdiy
第九序言T9 小时前
Python 数据处理进阶(十八)批量处理同结构文件:一个文件夹一次跑完
开发语言·python·自动化·pandas·数据处理
龙亘川11 小时前
构建城市公共安全数字底座:亘川智城智慧安防系统全维度解读
java·大数据·开发语言·人工智能·信息可视化
程序喵大人11 小时前
【C++入门】内存模型与资源管理 - 09 shared_ptr 和 weak_ptr 解决共享,也带来代价
开发语言·c++·资源管理·智能指针·内存模型
Raas10011 小时前
AI网关部署方案?从部署到上线全流程
java·开发语言·人工智能·gateway·ai网关·企业级ai网关·企业级ai产品
专注仿真12 小时前
线性回归和逻辑回归算法详解
开发语言·人工智能·python·大模型训练·控制算法
jimy113 小时前
C++ 中的 `T&&`:右值引用与转发引用
开发语言·c++