第一部分：纯蛋白质的力场构建
本步骤主要涉及的网站为charmm-gui(https://charmm-gui.org/)
该网站的获取需要使用教育邮箱(.edu)申请，申请中的姓名和学校需要与邮箱本身的一致，否则会申请失败。
①蛋白质的要求：蛋白质中的链要求不能断裂，所以我们在uniport中下载的蛋白质的立体结构需要在AlphaFoldDB中下载。
②本流程的实例蛋白为CDK4，我们下载的就是P11802
之后选择下载PDB file文件
我们就获得了一个cdk4.pdb文件，这样我们蛋白的完整结构就下载完成啦！！！
利用charmm-gui构建蛋白质的力场
1.点击网站左边的Input Generator中的PDB Reader & Manipulator
2.上传蛋白的.pdb格式文件，之后点击右下角的下一步
3.这一步就可以看蛋白有几条链还有它的长度，没有问题的话就点击下一步。
4.修改一下PH，改成7.2之后点击Apply,之后直接点击下一步
5.结果
6.之后点击左边的Input Generator中的Solution Builder
7.导入文件进行计算，点击下一步
8.调节PH(PH=7.0)
9.该步骤的参数如下，第一，点击
下拉，选择NaCl,之后点击Add Simple Ion Type,离子添加完成后需要点击Calculate Solvent Composution
直接点击下一步
下一步，勾线力场及后续的所需要的软件。
下载结果压缩文件
