你给项目写了 CLAUDE.md，拆了几条 rule，做了几个 skill，又接了两个 MCP。然后 agent 该犯的错照犯，定下的规矩当没看见。
这时候你会怀疑一件事：它到底有没有读到？
这个问题比看起来值钱。因为「我配了一个文件」和「这个文件的内容真的影响了模型这一步的决策」之间，隔着好几道关，每道关都可能悄悄漏掉。我把它拆成四件常被当成一件的事：
关联 ≠ 加载 ≠ 读到 ≠ 遵守。
你在 .claude/ 里放了文件，是「关联」；它在这次会话里被拼进了上下文窗口，是「加载」；模型在当前这一步真的把它纳入了判断，是「读到」；它照着做了，才是「遵守」。四件事任意一环断掉，结果都是「规矩没生效」，但断在哪一环，排查方式完全不同。
这篇先把接知识库的几种方式过一遍，再讲每种方式到底在什么时机、以什么形式进上下文，最后讲怎么确认它真进去了、真受约束了。还是 Claude Code（下称 CC）和 Codex 两侧对着看，CC 一侧以官方文档为准、措辞保守，Codex 一侧能落到源码行号的我都标了出处。
一、知识库有哪些访问途径
先把「知识库」说清楚：这里指你想让 agent 持续遵守的东西------项目约定、编码规范、工作流、领域知识、可调用的能力、外部数据。把这些接给 agent，CC 和 Codex 各有一组机制，大体能一一对上：
| 机制 | Claude Code | Codex |
|---|---|---|
| 主指令文件 | CLAUDE.md：项目 / 用户 / 组织三类作用域，加上子目录里的 CLAUDE.md | AGENTS.md：全局 / 项目 / 子目录多级 |
| 拆分规则 | .claude/rules/：拆成多个文件，可按文件路径生效 |
config 里的 instructions：跟着配置走的指令 |
| 自动记忆 | Auto memory：模型自己攒的笔记，入口 MEMORY.md |
------ |
| 技能 | Skill：带触发条件的可装载行为单元 | skill：同名概念，叫法略有差别 |
| 外部工具 / 数据 | MCP | MCP |
| 特殊注入口 | @import、--append-system-prompt |
------ |
这几种途径看着差不多，关键差别都在下一节。它们进上下文的时机和形式不一样，正是「我配了它却没生效」的根源。
二、每种途径怎么进上下文
差别藏在三件事里：什么时候进上下文、以什么身份进、哪里会悄悄漏。先用一张表摆清楚骨架，源码出处放在表下：
| 途径 | 什么时候进上下文 | 以什么身份 / 形式 | 最容易栽的点 |
|---|---|---|---|
| CLAUDE.md / AGENTS.md | 开机加载「启动目录往上」那条链；子目录的要等 agent 真去读那个目录的文件才进 | 当作 user 消息注入，不是 system prompt------是 context，不是强制配置 | 子目录规则这次没碰就一直不在；AGENTS.md 默认 32 KiB 上限，超了直接截断（不是没重视，是没进去） |
.claude/rules/ |
带 paths: 的按 glob 路径触发；不带 paths 的才开机全量 |
同 CLAUDE.md，落在 user 侧 | 写了 paths 却没动对应目录 → 规则不生效，这是设计不是 bug |
| skill | 开机只进元数据（名字 + description）；正文等被触发才加载 |
progressive disclosure：不用几乎不占 token，一旦加载则后续每轮常驻 | description 没匹配上 → 正文一字不进；「被发现 / 被加载 / 被触发」是三件事 |
| MCP | 工具定义（schema）开机就进上下文 | 占 token 的工具清单 | 挂得多、每个工具又多 → 先交一大笔上下文「租金」 |
| 权限 / hook | 工具真正执行前拦截，不经过模型的意愿 | 客户端硬约束，跳出上面这条「进上下文」的链 | 想「不管模型怎么想都拦住」就别写进 CLAUDE.md，用 deny 规则或 PreToolUse hook |
几个值得记的细节和出处：
- CLAUDE.md ：官方定性是 context、不是 enforced configuration，写在里面的「务必 / 绝不」本质是请求不是开关；
@import开机展开、最多 4 跳，块级 HTML 注释注入前被剥掉，可拿来给人留言不占 token。 - AGENTS.md ：多级发现见
core/src/agents_md.rs，32 KiB 上限是AGENTS_MD_MAX_BYTES（core/src/config/mod.rs:186）；被包成# AGENTS.md instructions .../</INSTRUCTIONS>标签的 user 指令（core/src/context/user_instructions.rs），再和 config instructions 合并。 - skill ：元数据在列表里有上限，
description+when_to_use合起来超过 1536 字符会被截断；Codex 侧元数据按预算渲染后拼进 developer 消息（core/src/session/mod.rs的build_available_skills）。 - MCP ：工具从连接管理器列出、过滤可访问且启用的再拼进指令（
core/src/connectors.rs）。 - 权限 ：CC 是
allow/ask/deny三数组，判定 deny > ask > allow，再叠 permission mode（default / acceptEdits / plan / bypassPermissions）；Codex 做进类型系统------SandboxPolicy四种取值（protocol/src/protocol.rs:878）、AskForApproval五种（:784）、细粒度GranularApprovalConfig（:817-854）能分别管 skill / rules / MCP 要不要逐次确认。
一句话收住这节：CLAUDE.md / rule / skill 里的话，是给模型看的建议；权限和 hook，是替你拦动作的闸。想要「一定」，得用后者。
三、怎么确认 agent 真的读到了、真的受限了
🖼 配图位：verify.png ------ 编辑器拖入 verify.png
这是这篇最该解决的问题。把前面那条「关联 ≠ 加载 ≠ 读到 ≠ 遵守」拆开，验证手段也分两层：一层看东西进没进上下文窗口（静态），一层看 agent 实际跑了什么（行为）。
先看：东西到底进没进上下文
CC 有几个现成的口子。
/context：看当前上下文窗口的 token 分布------system prompt、工具、MCP、记忆文件、消息各占多少。最直接的判断是，你以为加载了的东西，如果这里没有它的份额，那就是没进去。/memory：列出本次会话实际加载了哪些 CLAUDE.md、CLAUDE.local.md 和 rules 文件。不在这个列表里的文件，模型就是看不见。排查「CLAUDE.md 不生效」，第一步就是跑它确认文件在不在列表。InstructionsLoadedhook：想要精确日志，可以用这个 hook 记录到底哪些指令文件、在什么时候、为什么被加载，特别适合排查 path-scoped rule 和子目录里那种懒加载的文件。
还有几个由前面机制直接推出来的检查动作：子目录的 CLAUDE.md、MEMORY.md 200 行以外的内容、topic 文件，开机都不进上下文，要确认它们生效，就看模型有没有真的去 read 对应目录的文件；/compact 之后，项目根的 CLAUDE.md 会被重新读盘注入，子目录的不会，所以压缩后规则「变松」往往是这个原因。
再看：agent 实际跑了什么
静态检查能告诉你「东西在不在窗口里」，但回答不了「你那个 skill 这次到底触发没触发」「派出去的子 agent 有没有继承你的规则」。这些是行为层的问题，得看一次真实运行的执行轨迹。
这一层可以用一个开源的 profiler，比如 cctrace（Go 写的，MIT，本地跑，不联网）。它的做法是包一层你的 agent（cctrace claude -- claude 或 cctrace codex -- codex），把这次运行的事件铺成一条本地的瀑布流时间线。对应到本文的问题，它有几样东西正好对得上：
- 它在会话启动时会收集「这台机器上发现了哪些 skill，以及它们的 description」，又在时间线上标出「哪个 skill 这次真的触发了」。两相对照，你就能判断：如果某个 skill 在清单里、却整场没 fire，那就是它的
description没让模型路由过来，问题在描述，不在正文。 - 它把子 agent 的 fan out 单独标出来。这点很关键：子 agent 跑在自己独立的上下文里，并不自动继承你主会话里那套 CLAUDE.md。很多「我明明写了规则，子任务却不守」的情况，就是因为活是子 agent 干的，而它从来没读到过那条规则。在时间线上看到 fan out，你才会意识到该把规则下沉到子 agent 能拿到的地方。
- 它把工具调用、模型思考、卡顿、重试都摆在同一条时间轴上，于是「这一步到底调了什么、花在哪」一目了然。
简单说，内置的 /context、/memory 回答「上下文里有什么」，profiler 回答「agent 实际做了什么」。两边对上，才算真的确认了。
Codex 一侧：把发给模型的东西原样落盘
Codex 还提供了一条更彻底的路。设置环境变量 CODEX_ROLLOUT_TRACE_ROOT（rollout-trace/src/thread.rs），它会把每次推理的请求、响应、工具调用这些原始事件和 payload 落盘成一个本地 bundle，事后用离线 reducer 重建出「模型实际看到的那串 conversation items」。这是最硬的 ground truth：不是推断它读没读到，是把真正送进模型的东西原样存下来，逐条核对。会话级的 rollout 持久化在 core/src/session/mod.rs 一带。
想要「一定生效」，只有两条路
绕了一圈，结论很短：context 里的文字不保证被严格执行。你真要某条规则「一定」生效，只有两条路：要么把它提到 system prompt 那一级（CC 的 --append-system-prompt，或组织级的 managed 配置），要么干脆别走「说服模型」这条路，用 hook 和权限规则在客户端把动作直接拦掉。前者提高被遵守的概率，后者根本不给模型选择的机会。
小结
配了，不等于加载了；加载了，不等于读到了；读到了，不等于会遵守。
接知识库的每种方式，都卡在这条链的不同位置：CLAUDE.md 和 rule 卡在「什么时机、以什么身份进上下文」，skill 卡在「description 有没有让它被路由」，MCP 卡在「值不值得占这份上下文」，权限则干脆跳出这条链、在客户端硬拦。
排查的时候，先用 /context、/memory、InstructionsLoaded 确认东西进没进窗口，再用一次真实运行的执行轨迹确认 agent 到底跑了什么、skill 有没有触发、子 agent 有没有继承规则。想要确定性，就别赌上下文里的文字被严格执行，把它提到 system prompt，或者交给 hook 和权限。
下一篇回到长任务那条线：harness 怎么扛住一个跨很多轮的会话------compaction、memory、goal 是怎么配合的。
Harness Engineering 系列
围绕 coding agent 的「平台层（harness）与业务工程」，逐篇拆解：
- Harness 到底指什么 ------ 平台层与业务工程的边界
- 复杂任务的 Spec 怎么写 ------ 多 Agent、编排者入口、rules / docs / skills 组织
- Harness 怎么扩展：skill、配置目录与 hook ------ CC 与 Codex 的两套扩展机制
- Harness 怎么拿捏 agent：权限与 effort ------ CC 与 Codex 的控制面对比
- 费时费力做的 Spec 和知识库，Agent 真受约束了么 ------ 本篇
- Harness 怎么扛住长任务 ------ compact、memory、goal（写作中）