DuckDB 向量化与 Morsel-Driven Pipeline

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MonetDB/X100 确立的 向量批执行 被 DuckDB 与 ClickHouse 共同继承;DuckDB 在并行层采用 morsel-driven (HyPer 论文传统):Row Group 切成 morsel,线程池动态抢任务,而非静态 partition。本文从物理算子讲到 src/parallel/executor.cpp,并对照 ClickHouse 向量化(第 04 篇) 与 PostgreSQL 执行器 的 volcano 逐行模型。

版本锚定:DuckDB 1.x。


一、Volcano vs Vector vs Morsel

模型 数据单位 并行 代表
Volcano 1 row 难 PG 传统 plan
Vector batch(如 1024 行) 算子内 SIMD MonetDB/X100
Morsel-driven batch + 动态 work queue 核间负载均衡 HyPer, DuckDB

PostgreSQL 11+ 有部分 vectorization,但 OLTP 主路径仍是 tuple-at-a-time;DuckDB 纯分析 全路径向量 + morsel。

flowchart TB subgraph vol [Volcano PG] N1[Next tuple loop] end subgraph vec [Vector CH/DuckDB] B[Column batch] SIMD[SIMD filter/aggr] B --> SIMD end subgraph mor [Morsel DuckDB] Q[Task queue] W1[Worker] W2[Worker] Q --> W1 Q --> W2 end

二、Column Vector 与 Selection Vector

DuckDB DataChunk(概念名,源码见 src/common/types/data_chunk.cpp)持有:

  • 多列 Vector;
  • 行数 count;
  • 可选 Selection Vector(filter 后活跃行索引,避免物理删除)。

Filter 典型路径:

  1. 比较产生 SelectionVector;
  2. 下游算子只处理选中行;
  3. 常配合 字典编码 列避免物化。

ClickHouse ColumnUInt8 filter 类似,实现在 src/Columns/------第 04 篇 已述 Block 结构。


三、Physical Operator 与 Pipeline

物理计划树分解为 Pipeline :线性算子链 + 一个 Source + 一个 Sink。

flowchart LR SRC[Table Scan Source] F[Filter] P[Projection] H[Hash Join Probe] A[Hash Aggregate] SNK[Result Collector Sink] SRC --> F --> P --> H --> A --> SNK
  • Pipeline breaker :Hash Join Build、Hash Aggregate 等会 Barrier------先完成 build 再 probe。
  • Meta-Pipeline :复杂 JOIN 树多 pipeline 由 Executor 调度顺序。

源码入口:

  • src/execution/physical_operator.cpp
  • src/execution/operator/scan/physical_table_scan.cpp
  • src/execution/operator/join/physical_hash_join.cpp
  • src/execution/operator/aggregate/physical_hash_aggregate.cpp

四、Morsel-Driven 并行

4.1 划分

Table Scan 按 Row Group → morsel(默认与 Row Group 对齐或可再切)。每个 morsel 是一个 ParallelTask。

4.2 调度

TaskScheduler 维护 worker 线程;任务完成 push 新 morsel。负载均衡:慢 morsel(高 selectivity 后仍大)不阻塞快线程。

对比 ClickHouse:

  • CH:max_threads + parts 级并行 + MergeTree range 读;
  • DuckDB:单表 scan 也 morsel 并行,无 shard。

4.3 threads setting

sql 复制代码
SET threads = 8;

超过 CPU 核数可能因 contention 变慢------须本地 benchmark,本文不给倍数。


五、Hash Join 实现要点

DuckDB 默认 hash join(无 index nested loop 对事实表大 scan 不友好)。

Build 侧:

  • 向量化 insert hash table;
  • 字符串用 salted hash;
  • 大 build 可 external hash join spill 到 temp_directory。

Probe 侧:

  • morsel 并行 probe;
  • semi/anti join 优化消除不必要列。

ClickHouse ConcurrentHashJoin / grace hash 在 src/Processors/------分布式时还有 GLOBAL 广播(第 09 篇)。


六、Aggregation

6.1 单层聚合

PhysicalHashAggregate:hash table 键 = GROUP BY 列,值 = aggregate state。

6.2 两阶段 / 分区

高 cardinal GROUP BY:

  • 先 partition 再 partial aggregate;
  • spill 类似 join。

ClickHouse group_by_two_level_threshold 同族思路------配置(第 16 篇)。

6.3 DISTINCT

Often GROUP BY + COUNT 或专用 PhysicalDistinct------优化器 rewrite。


七、Optimizer 与 Pipeline 的衔接

src/optimizer/ 规则影响物理 plan:

  • Predicate pushdown 到 scan(Parquet row group stats);
  • Join order 动态规划 / 启发式;
  • Common subexpression elimination;
  • Top-N 下推(LIMIT + ORDER BY)。
sql 复制代码
EXPLAIN SELECT ...;
EXPLAIN ANALYZE SELECT ...;

EXPLAIN ANALYZE 输出 实际 timing------仅本地有效,不可跨文引用具体毫秒。


八、Table Scan 与 Segment Skip

读 ColumnSegment 时:

  1. 读 segment footer statistics;
  2. 若 max < predicate constant → skip entire segment;
  3. 否则 decompress + vector filter。

与 ClickHouse Mark Range + 跳数索引(第 07 篇) 同族 zonemap pruning。

Parquet 扫描复用 row group metadata ------read_parquet 不经过 DuckDB storage 仍享 skip。


九、Spill 与内存

Settings:

Setting 作用
memory_limit 进程软上限
max_temp_directory_size spill 上限
preserve_insertion_order 是否保序(影响并行)

OOM 时 DuckDB 尝试 spill;仍失败则报错------嵌入式 Python 需 catch。

ClickHouse OOM 见 max_memory_usage 与 经典故障(第 15 篇)。


十、并行 COPY 与 INSERT

sql 复制代码
COPY large_table FROM 'big.csv' (HEADER, DELIMITER ',');

Parser + 向量化 insert 可并行读文件------瓶颈常在磁盘或 CSV parse。

对比 ClickHouse INSERT FORMAT CSV + ingest 背压------DuckDB 单机 无 parts_to_throw_insert,但超大事务 checkpoint 压力存在。


十一、UDF 与向量边界

用户标量 UDF 若未向量化,可能 逐行回调 Python------destroy 性能。推荐:

  • DuckDB 原生 SQL / 宏;
  • Arrow 零拷贝接口;
  • 扩展 C++ UDF。

ClickHouse 同理:Python UDF 慢于原生 executable 或 SQL。


十二、与 ClickHouse Processors 对照

概念 DuckDB ClickHouse
批 DataChunk Block
图 Pipeline + MetaPipeline Processor DAG
并行 Morsel task queue max_threads, parts
远程 无 RemoteQueryExecutor
EXPLAIN EXPLAIN ANALYZE EXPLAIN PLAN, query_log

读 CH 源码 src/Processors/Executors/ExecutingGraph.cpp 与 DuckDB src/parallel/executor.cpp 可感受 调度哲学差异。


十三、PostgreSQL 执行器对照

PG 执行器(第 12 篇 PG) ExecProcNode 逐 plan node 递归;DuckDB 编译为 扁平 pipeline + 向量 primitive 。PG 向 OLAP 的 columnar store(cstore_fdw 等)不在 PG 核内------pg_duckdb 是旁路加速。


十四、Profiling

sql 复制代码
PRAGMA enable_profiling;
SELECT ...;
PRAGMA profiling_output = 'query.json';

Chrome trace 风格分析 morsel 并行度------工具随版本演进,以文档为准。

ClickHouse 用 query_log、trace_log(监控(第 14 篇))。


十五、实验框架(须本地执行)

15.1 并行度对比

sql 复制代码
SET threads=1;
SELECT sum(v) FROM big WHERE g > 0;
SET threads=8;
SELECT sum(v) FROM big WHERE g > 0;

记录 EXPLAIN ANALYZE 中 total time------仅本地。

15.2 Join spill

sql 复制代码
SET memory_limit='128MB';
SELECT count(*) FROM big a JOIN big b ON a.id = b.id;

观察是否 spill 或失败。


十六、学术谱系:X100 → Morsel → DuckDB Pipeline

阶段 文献 / 系统 贡献
2005 MonetDB/X100, CIDR 向量批执行奠基(与 第 04 篇 同源)
2014 Leis et al., Morsel-Driven Parallelism, SIGMOD 动态任务窃取;抗 skew;HyPer 传统
2018 Kersten et al., PVLDB compiled vs vectorized 实证争论
2019+ DuckDB 全路径向量 + morsel;嵌入式进程内(Raasveldt & Mühleisen, SIGMOD 2019 demo)

与 ClickHouse 对照 :CH 用 PipelineExecutor 调度 IProcessor(第 04 篇);DuckDB 用 morsel 队列在 核间 抢 Row Group 切片。两者都属 X100 谱系,并行调度哲学不同------不是「谁更向量化」。

16.1 争论:静态分区 vs morsel

  • 静态 partition:实现简单,skew 时核空转。
  • Morsel / work stealing(Leis 2014):负载均衡好,调度与缓存局部性有代价。

DuckDB 选后者服务 单机多核分析 ;CH 服务端还要面对 多查询 + merge 线程 争抢------并行模型不可直接照搬。

16.2 工程间隙

论文 / HyPer 设定 DuckDB 1.x 嵌入
独占服务器、长查询 notebook / 应用进程共享内存
少谈持久化 merge .duckdb checkpoint 与 CH Part merge 不同账单
理想 SIMD 对齐 Selection Vector + 字典列使路径分支更多
无多租户 单文件写锁限制并发 ingest

16.3 开放问题

  1. Spill 阈值与 morsel 粒度如何联合调优? 可检验:降 memory_limit 后 EXPLAIN ANALYZE 的 spill 与线程空闲(入口:Leis SIGMOD'14;DuckDB Memory Management)。
  2. 嵌入式场景是否应默认更激进 codegen? 与第 04 篇 CH 问题对称;Kersten 2018 仍是坐标。
  3. 与 CH Processors 在同一硬件上的并行效率------须固定 query mix 实测,本文不排名。

十七、小结

DuckDB 执行层 = 向量批 + morsel-driven 任务窃取 ;优化器把 skip 下推到 Segment/Parquet。理解 Pipeline breaker 与 spill,就理解嵌入式 OLAP 在 单机核数 上的扩展上限。

附录 A、物理算子目录(源码)

算子 路径方向
Table Scan operator/scan/physical_table_scan.cpp
Filter operator/filter/physical_filter.cpp
Hash Join operator/join/physical_hash_join.cpp
Cross Product operator/join/physical_cross_product.cpp
Hash Aggregate operator/aggregate/physical_hash_aggregate.cpp
Window operator/aggregate/physical_window.cpp
Order By operator/order/physical_order.cpp
Limit operator/limit/physical_limit.cpp
Insert operator/persistent/physical_insert.cpp

附录 B、Pipeline Breaker 列表

Hash Join Build、Hash Aggregate、Sort、部分 Window 会 barrier------先完成 build 再 probe/输出。理解 breaker 数量解释 为何某些查询并行度低。

附录 C、Grace Hash Join

Build 侧大于 memory 时分区 spill 到 temp_directory,逐分区 join。ClickHouse 类似 grace hash in processors。调小 memory_limit 可强制 spill 测试(测试库)。

附录 D、Optimizer 规则(代表性)

Filter pushdown、Join reorder、Common subexpression、Top-N pushdown、Duplicate grouping removal。EXPLAIN 输出 logical → physical 变化。

上一篇 :DuckDB 架构

下一篇 :ClickHouse vs DuckDB 选型

参考资料

核心论文

  1. Boncz et al., MonetDB/X100: Hyper-Pipelining Query Execution, CIDR 2005(A 级)。
  2. Leis et al., Morsel-Driven Parallelism: A NUMA-Aware Query Evaluation Framework for the Many-Core Age, SIGMOD 2014(A 级)。
  3. Kersten et al., Everything You Always Wanted to Know About Compiled and Vectorized Queries..., PVLDB 2018(A 级)。
  4. Raasveldt & Mühleisen, DuckDB: an Embeddable Analytical Database, SIGMOD 2019 demo(B/A 级系统介绍)。

规范 / 源码 / 文档

  1. DuckDB Documentation, Execution / Parallelism(1.x;A 级)。
  2. DuckDB Source, src/execution/、src/parallel/(A 级)。
  3. ClickHouse Source, src/Processors/(对照;A 级)。
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