cadd

技术支持日志2026.10.13——MOE 反应库显示 C2=0：原来是显式氢触发了输入限制用 MOE 2024.0601 将 Cys 与 CL2A–SN-38 做 Michael 加成时，Combinatorial Library 显示 C2=0，产物数也为0。检查三维结构，maleimide 的双键和两个羰基都正常。

# MOE 肽类药物设计（十二）：柔性肽怎么 Dock？从 Conformational Search 到 General Dock上一篇介绍了肽对接的两条路线：Protein–Protein Docking 和 Protein–Ligand Docking。

# MOE 肽类药物设计（八）：让自定义非天然氨基酸真正可用——Rotamer Library 怎么建立？上一章完成以后，我们已经有了一个：nnaa_library.mdb其中保存了 CYC4、AZE2 等自定义非天然氨基酸。

MOE 肽类药物设计（七）：天然氨基酸不够用？在 MOE 中创建自己的非天然氨基酸上一篇中，我们已经使用 Molecule Builder 对肽上的单个原子进行修改。如果进一步思考，就会发现一个很自然的问题：

MOE 肽类药物设计（四）：结合位点还有没有优化空间？用 Surface 和 Protein Patches 看懂蛋白口袋上一节中，我们已经发现 p53 的 Phe19、Leu22、Trp23 和 Leu26 与 Mdmx 存在较多接触。

MOE基于结构的药物设计（七）：Ligand R-Vectors——如何判断配体可以从哪里继续生长？前两篇中，我们已经从两个角度分析了 EGFR–Tarceva（1M17）的结合口袋：Interaction Surface：哪里还有空间？

2023-python pdf转换为PPT代码python pdf转换为PPT代码

2023-CADD、AIDD/分子对接、gromacs分子动力学全程实操、代谢组学CADD(Computer Aided Drug Design):计算机辅助药物设计，依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果，针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点，并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征，以计算机化学为基础，通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用，考察药物与靶点的结构互补、性质互补等，设计出合理的药物分子。它是设计和优化先导化合物的方法，CADD的应用，包括基于结构的药物设计（SBDD）、基于配体的药

我是有底线的