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super大力张5 天前
cadd·moe
# MOE 肽类药物设计(八):让自定义非天然氨基酸真正可用——Rotamer Library 怎么建立?上一章完成以后,我们已经有了一个:nnaa_library.mdb其中保存了 CYC4、AZE2 等自定义非天然氨基酸。
super大力张7 天前
cadd·moe·药物设计
MOE 肽类药物设计(七):天然氨基酸不够用?在 MOE 中创建自己的非天然氨基酸上一篇中,我们已经使用 Molecule Builder 对肽上的单个原子进行修改。如果进一步思考,就会发现一个很自然的问题:
super大力张11 天前
cadd·moe·药物设计
MOE 肽类药物设计(四):结合位点还有没有优化空间?用 Surface 和 Protein Patches 看懂蛋白口袋上一节中,我们已经发现 p53 的 Phe19、Leu22、Trp23 和 Leu26 与 Mdmx 存在较多接触。
super大力张21 天前
数据库·算法·cadd·moe·svl·基于结构的药物设计
MOE基于结构的药物设计(七):Ligand R-Vectors——如何判断配体可以从哪里继续生长?前两篇中,我们已经从两个角度分析了 EGFR–Tarceva(1M17)的结合口袋:Interaction Surface:哪里还有空间?
itwangyang5203 年前
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2023-python pdf转换为PPT代码python pdf转换为PPT代码
itwangyang5203 年前
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2023-CADD、AIDD/分子对接、gromacs分子动力学全程实操、代谢组学CADD(Computer Aided Drug Design):计算机辅助药物设计,依据生物化学、酶学、分子生物学以及遗传学等生命科学的研究成果,针对这些基础研究中所揭示的包括酶、受体、离子通道及核酸等潜在的药物设计靶点,并参考其它类源性配体或天然产物的化学结构特征,以计算机化学为基础,通过计算机的模拟、计算和预算药物与受体生物大分子之间的相互作用,考察药物与靶点的结构互补、性质互补等,设计出合理的药物分子。它是设计和优化先导化合物的方法,CADD的应用,包括基于结构的药物设计(SBDD)、基于配体的药
我是有底线的