生信

Biomamba生信基地24 天前
开发语言·r语言·生信·医药
R语言基础| 下载、安装在此前的单细胞教程中,许多小伙伴都曾因为R语言基础不足而十分苦恼。R语言是一种开源的编程语言和软件环境,专门用于统计分析、图形表示和数据挖掘。它最初由Ross Ihaka和Robert Gentleman在1993年创建,旨在为统计学家和数据分析师提供一个广泛的统计(线性和非线性建模、经典统计测试、时间序列分析、分类、聚类等)和图形技术的集成环境。R语言以其强大的数据处理能力、图形系统以及在统计计算和图形显示方面的灵活性而闻名。此外,R语言具有一个庞大的用户社区,提供了大量的包(libraries)和工具
Biomamba生信基地1 个月前
开发语言·r语言·生信·医药
R语言基础| 创建数据集在R语言中,有多种数据类型,用以存储和处理数据。每种数据类型都有其特定的用途和操作函数,使得R语言在处理各种数据分析任务时非常灵活和强大:
Biomamba生信基地1 个月前
r语言·可视化·生信·医药
R语言基础| 可视化初探(ggplot2)写在前面ggplot2 是一个基于 R 语言的数据可视化包,提供了一种结构化的方法来描述和构建图表,因此被广泛用于制作可视化图表。其是tidyverse数据科学生态系统的一部分。
陆沙3 个月前
linux·centos·aigc·生物信息·生信
centos-LLM-生物信息-BioGPT-使用1参考: GitHub - microsoft/BioGPT https://github.com/microsoft/BioGPT
陆沙3 个月前
linux·人工智能·centos·aigc·生物信息·生信
centos-LLM-生物信息-BioGPT安装参考: GitHub - microsoft/BioGPT https://github.com/microsoft/BioGPT
Biomamba生信基地3 个月前
开发语言·r语言·生信
R语言入门课| 04 R语言基本函数视频教程大家可以先做一做R语言基础小测验,看看自己是否需要跟我们5.5h入门R语言的课程。先上教程视频,B站同步播出:
Biomamba生信基地3 个月前
开发语言·r语言·生信
R语言基础小测验测试题此前我们进行了5.5h入门R语言的教学,课后给大家留下了如下习题,大家可以检验一下自己的R语言的学习成果。
Biomamba生信基地3 个月前
开发语言·r语言·生信
R语言入门课| 02 R及Rstudio的下载与安装视频教程先上教程视频,B站同步播出:https://www.bilibili.com/video/BV1miNVeWEkw
Biomamba生信基地4 个月前
linux·服务器·生信
Biomamba劝学写在前面最近也有个事,值得说道一下。我们的足够支持你完成硕博生涯的生信环境,给大家提供的是生信环境、算力,而不是生信辅导。况且我们还给大家提供了五次技术支持工单:白嫖五次技术支持。即使是这样,大家在问我们服务器使用相关的问题时,其实我们还是会给大家答疑的。不过还是希望大家能给听从我们的建议,先行学习:十小时学会Linux。这就有一个悖论,如果给大家无休止的答疑,就远远超出了我们的义务范围以及承受能力。若是不给大家答疑,大家又觉得是服务器产品的问题。实际在我们观察中,用户问到的问题99.99%都是因为Lin
Biomamba生信基地4 个月前
信息可视化·r语言·生信
R语言基础| 基本图形绘制写在前面ggplot2 是一个基于 R 语言的数据可视化包,提供了一种结构化的方法来描述和构建图表,因此被广泛用于制作可视化图表。其是tidyverse数据科学生态系统的一部分。
Biomamba生信基地4 个月前
开发语言·r语言·生信
R语言基础| 基本统计分析写在前面R语言拥有丰富的数据处理、统计分析和机器学习工具包,涵盖了从简单的描述统计到复杂的模型建立的各个方面。再加上数据的处理可以完美的衔接后续的可视化,这使得它成为处理各种类型和规模的数据集的理想选择。
星石传说4 个月前
python·生信·环境数据·分布图
python绘制年平均海表温度、盐度、ph分布图python绘制年平均海表温度、盐度、ph图本文主要使用python绘制年平均海表温度、盐度、ph分布图,所用数据来源于Bio-ORACLE 参考文章: Python绘制海表温度 【python海洋专题十二】年平均的南海海表面温度图
Biomamba生信基地4 个月前
开发语言·r语言·生信
两天入门R语言,周末开讲R语言入门课生信基地希望能够给大家提供系统性、形成性、规范性的生信教学。前面几次活动中同学们表示希望能够有线下集中学习以及针对性的指导、答疑。所以,此次我们将于2025年02月22日~23日(周六周日)推出"生信R语言入门课"(线上线下均可参与),共分为"R介绍"、"R语言数据对象"、"基本数据管理"、"图形初级(ggplot2)"四个模块。当然,我们也不做生信快餐,本次活动有回放,后续我们会持续拉群在群里进行课程内容的答疑(也方便错过活动的小伙伴加入)。
Biomamba生信基地5 个月前
学习·r语言·生信
R语言学习计划启动R语言入门课生信基地已然落地,我们希望能够给大家提供系统性、形成性、规范性的生信教学。前面几次活动中同学们表示希望能够有线下集中学习以及针对性的指导、答疑。所以,此次我们计划于2025年02月22日~23日(周六周日)推出"生信R语言入门课"(线上线下均可参与),共分为"R介绍"、"R语言数据对象"、"基本数据管理"、"图形初级(ggplot2)"四个模块。当然,我们也不做生信快餐,本次活动有回放,后续我们会持续拉群在群里进行课程内容的答疑(也方便错过活动的小伙伴加入)。
Biomamba生信基地6 个月前
开发语言·r语言·生信
R语言基础| 方差分析写在前面方差分析(ANOVA,Analysis of Variance)是统计学中一种用来比较三个或三个以上样本均值是否存在显著差异的方法。方差分析基于样本数据的方差来判断整体均值之间的差异,是处理多个样本组数据对比问题的常用技术。
Biomamba生信基地6 个月前
开发语言·r语言·kotlin·生信
R语言基础| 广义线性模型12.1 广义线性模型(Generalized Linear Model)和glm()函数前面学到的OLS回归和方差分析仅适用于因变量符合正态分布的数据,广义线性模型则可以用于因变量不合符合正态分布的数据:
陆沙6 个月前
数据分析·生物信息·生信
生物信息学导论-北大-RNA-Seq数据分析ref: https://www.coursera.org/learn/sheng-wu-xin-xi-xue/home
鸡鸭扣7 个月前
glide·生物信息学·生信·分子对接·薛定谔·网络药理学·maestro
网络药理学之薛定谔Schrödinge Maestro:6、分子对接(Glide、Ligand docking)和可视化本人是win11,薛定谔版本是12.9。 官网:https://www.schrodinger.com/ 本篇文章的示例大分子蛋白PDB ID为4KNN,小分子配体的MOL ID为MOL004004。 本文部分图源来自知乎https://zhuanlan.zhihu.com/p/416698194,推荐为原作者贡献阅读量捏。
鸡鸭扣8 个月前
生物信息学·r·生信·rstudio
生信:TCGA学习(R、RStudio安装与下载、常用语法与常用快捷键)macOS系统,已安装homebrew且会相关命令。近期在整理草稿区,所以放出该贴。官网地址:https://posit.co/download/rstudio-desktop/
Amyniez1 年前
开发语言·信息可视化·r语言·生信·anova·线性混合效应模型
【R语言】数据可视化分析和统计检验——线性和线性混合效应模型🌍✨📚最近听了北京理工大学王蓓老师关于R语言的讲座,受益匪浅,现在把自己学习的内容和收获进行记录和分享。