生信

鸡鸭扣11 天前
生物信息学·r·生信·rstudio
生信:TCGA学习(R、RStudio安装与下载、常用语法与常用快捷键)macOS系统,已安装homebrew且会相关命令。近期在整理草稿区,所以放出该贴。官网地址:https://posit.co/download/rstudio-desktop/
Amyniez5 个月前
开发语言·信息可视化·r语言·生信·anova·线性混合效应模型
【R语言】数据可视化分析和统计检验——线性和线性混合效应模型🌍✨📚最近听了北京理工大学王蓓老师关于R语言的讲座,受益匪浅,现在把自己学习的内容和收获进行记录和分享。
Amyniez6 个月前
开发语言·经验分享·数据分析·r语言·生信·mental test·linket
R语言:Mantel Test分析与绘图Mantel test分析对两个矩阵相关关系进行检验。可以用在生态学上,用来检验群落距离矩阵(如 Bray-Curtis distance matrix)和环境变量距离矩阵(如 pH, 温度 或者地理位置的差异矩阵)之间的相关性(Spearman、Pearson)。Mantel test的相关性系数越大,p值越小,则说明环境因子对微生物群落的影响越大。同时,mantel test的偏分析(partial Mantel test等)可排除环境因子之间自相关的干扰。   Mantel test分析结果:   
慎终君1 年前
conda·anaconda·miniconda·conda升级·生信
conda从4.12升级到最新版23.9 自动升级失败 手动无损升级方法最新版conda有多线程下载,还做了一些其它易用性改动,所以决定从很老的4.12版本升级到最新版。因为版本差别过大,使用自带的conda update conda已经不起作用了。决定手动升级,过程如下: