转录组

翰佰尔HiOmics云分析19 天前
r语言·转录组·krgg
转录组分析实战:GO与KEGG富集分析原理及R语言实现1. 富集分析基础知识1.1 什么是富集分析?为什么要做富集分析?富集分析(Enrichment Analysis)是生物信息学中一种重要的分析方法,主要用于识别在特定生物样本(如基因集、代谢物集或其他分子集合)中是否存在某种功能类别或通路的显著性聚集现象。该方法广泛应用于基因表达分析、蛋白质组学、代谢组学等领域,有助于解析复杂的生物学过程、疾病发生机制以及基因功能注释等问题。
东翎赋1 年前
转录组·中药类·代谢组
BMC Genomics | 综合代谢组学和转录组学分析揭示了菊花黄酮和咖啡酰奎宁酸的生物合成机制杭白菊是一种流行的药用和食用植物,主要通过黄酮类和咖啡酰奎宁酸(CQAs)的存在发挥其生物活性。然而,菊花头状花序中黄酮和CQA生物合成的调控机制尚不清楚。
爱基百客1 年前
转录组·atac-seq
Nature子刊 | ATAC-seq、RNA-seq和蛋白组联合分析揭示脂质激活转录因子PPARα在肾脏代偿性肥大的作用机制2023年6月,美国国立心肺血液研究所的研究团队在Nature Communications上发表题为“Signaling mechanisms in renal compensatory hypertrophy revealed by multi-omics”的文章,该研究通过在单侧肾切除的小鼠模型中使用多组学方法(蛋白质组学、RNA-seq 和ATAC-seq等)识别肾近端小管中与代偿性肥大相关的信号传导过程,证明脂质激活转录因子 PPARα 是近端小管代偿性肥大的重要决定因素,对肾脏代偿性肥大的机制
小杜的生信筆記2 年前
开发语言·r语言·生物信息学·基因组组·转录组·生物信息学分析
R语言,数据类型转换今天是4月份的第一天,再过2天后再一次迎来清明小假期。木鸡大家是否正常放假呢?我们在使用R语言做数据分析时,会一直对数据进行不同类型的转换,有时候会被自己弄晕掉,那么就只能一次一次的去解决,去寻找,去学习相关的知识点。
小杜的生信筆記2 年前
r语言·生物信息学·数据转换·基因组组·转录组·参考基因组·生物信息学分析
R语言技能 | 不同数据类型的转换今天是4月份的第一天,再过2天后再一次迎来清明小假期。木鸡大家是否正常放假呢?我们在使用R语言做数据分析时,会一直对数据进行不同类型的转换,有时候会被自己弄晕掉,那么就只能一次一次的去解决,去寻找,去学习相关的知识点。
我是有底线的