TFRecords详解

内容目录

• [TFRecords 是什么](#TFRecords 是什么)
• 序列化(Serialization)
• • tf.data
• [图像序列化（Serializing Images)](#图像序列化（Serializing Images))
• • tf.Example
  • 函数封装
• 小结

TFRecords 是什么

TPU拥有八个核心，充当八个独立的工作单元。我们可以通过将数据集分成多个文件或分片（shards），更有效地将数据传输给每个核心。这样，每个核心都可以在需要时获取数据的独立部分。

在TensorFlow中，用于分片的最方便的文件类型是TFRecord。TFRecord是一种包含字节串序列的二进制文件。数据在写入TFRecord之前需要被序列化（编码为字节串）。

在TensorFlow中，最方便的数据序列化方式是使用tf.Example封装数据。这是一种基于谷歌的protobufs的记录格式，但专为TensorFlow设计。它更或多或少地类似于带有一些类型注释的字典。

首先，我们将介绍如何使用TFRecords读取和写入数据。然后，我们将介绍如何使用tf.Example封装数据。

Protobufs（Protocol Buffers），也称为Protocol Buffers语言，是一种由Google开发的数据序列化格式。它可以用于结构化数据的序列化、反序列化以及跨不同平台和语言的数据交换。通过在一个结构体定义文件中定义数据结构，然后使用相应的编译器将其编译为特定语言的类，您可以方便地在不同的系统和编程语言之间共享和传输数据。

序列化(Serialization)

TFRecord是TensorFlow用于存储二进制数据的一种文件类型。TFRecord包含字节串序列。下面是一个非常简单的TFRecord示例：

import tensorflow as tf
import numpy as np

PATH = '/kaggle/working/data.tfrecord'

with tf.io.TFRecordWriter(path=PATH) as f:
    f.write(b'123') # write one record
    f.write(b'xyz314') # write another record

with open(PATH, 'rb') as f:
    print(f.read())

TFRecord是一系列字节，因此在将数据放入TFRecord之前，我们必须将数据转换为字节串。我们可以使用tf.io.serialize_tensor将张量转换为字节串 ，使用tf.io.parse_tensor将其转换回张量。在解析字符串并将其再次转换为张量时，保持张量的数据类型（在这种情况下为tf.uint8）非常重要，因为您必须在解析过程中指定该数据类型。

x = tf.constant([[1, 2], [3, 4]], dtype=tf.uint8)
print('x:', x, '\n')

x_bytes = tf.io.serialize_tensor(x)
print('x_bytes:', x_bytes, '\n')

print('x:', tf.io.parse_tensor(x_bytes, out_type=tf.uint8))

tf.data

那么如何将数据集写入TFRecord呢？如果您的数据集由字节串组成，您可以使用data.TFRecordWriter。要再次读取数据集，可以使用data.TFRecordsDataset。

from tensorflow.data import Dataset, TFRecordDataset
from tensorflow.data.experimental import TFRecordWriter

# 创建一个小数据集
ds = Dataset.from_tensor_slices([b'abc', b'123'])

# 写入数据
writer = TFRecordWriter(PATH)
writer.write(ds)
    
# 读取数据集
ds_2 = TFRecordDataset(PATH)
for x in ds_2:
    print(x)

如果您的数据集由张量组成，请首先通过在数据集上映射tf.io.serialize_tensor来进行序列化。然后，在读取数据时，使用tf.io.parse_tensor来将字节串转换回张量。

features = tf.constant([
    [1, 2],
    [3, 4],
    [5, 6],
], dtype=tf.uint8)
ds = Dataset.from_tensor_slices(features)

# 对张量进行序列化操作
# 通过使用 `map` 函数，可以在数据集中的每个张量上应用 `tf.io.serialize_tensor` 进行序列化操作。
ds_bytes = ds.map(tf.io.serialize_tensor)

# 写入数据
writer = TFRecordWriter(PATH)
writer.write(ds_bytes)

# 读取数据(反序列化)
ds_bytes_2 = TFRecordDataset(PATH)
ds_2 = ds_2.map(lambda x: tf.io.parse_tensor(x, out_type=tf.uint8))

# They are the same!
for x in ds:
    print(x)
print()
for x in ds_2:
    print(x)

# 简化
def parse_serialized(serialized):
    return tf.io.parse_tensor(serialized, out_type=tf.uint8)  # 修改 out_type 根据您的张量数据类型

ds_3 = TFRecordDataset(PATH)

ds_3 = ds_3.map(parse_serialized)

for x in ds_3:
    print(x) #结果和上面一致

图像序列化（Serializing Images)

对图像进行序列化有多种方法：

• 使用tf.io.serialize_tensor进行原始编码，使用tf.io.parse_tensor进行解码。
• 使用tf.io.encode_jpeg进行JPEG编码，使用tf.io.decode_jpeg或tf.io.decode_and_crop_jpeg进行解码。
• 使用tf.io.encode_png进行PNG编码，使用tf.io.decode_png进行解码。

只需确保使用与您选择的编码器相对应的解码器。通常，在使用TPU时，使用JPEG编码对图像进行编码是一个不错的选择，因为这可以对数据进行一定程度的压缩，从而可能提高数据传输速度。

from sklearn.datasets import load_sample_image
import matplotlib.pyplot as plt

# Load numpy array
image_raw = load_sample_image('flower.jpg')
print("Type {} with dtype {}".format(type(image_raw), image_raw.dtype))
plt.imshow(image_raw)
plt.title("Numpy")
plt.show()

from IPython.display import Image

# jpeg encode / decode
image_jpeg = tf.io.encode_jpeg(image_raw)
print("Type {} with dtype {}".format(type(image_jpeg), image_jpeg.dtype)) 
print("Sample: {}".format(image_jpeg.numpy()[:25])) #显示前25个编码后的字节
Image(image_jpeg.numpy())

image_raw_2 = tf.io.decode_jpeg(image_jpeg)

print("Type {} with dtype {}".format(type(image_raw_2), image_raw_2.dtype))
plt.imshow(image_raw_2)
plt.title("Numpy")
plt.show()

tf.Example

如果您有结构化数据，比如成对的图像和标签，该怎么办？TensorFlow还包括用于结构化数据的API，即tf.Example。它们基于谷歌的Protocol Buffers。

一个单独的Example旨在表示数据集中的一个实例，比如一个（图像、标签）对。每个Example都有Features，这被描述为特征名称和值的字典。一个值可以是BytesList、FloatList或Int64List，每个值都包装为单独的Feature。没有用于张量的值类型；相反，使用tf.io.serialize_tensor对张量进行序列化，通过numpy方法获取字节串，并将其编码为BytesList。

以下是我们如何对带有标签的图像数据进行编码的示例：

from tensorflow.train import BytesList, FloatList, Int64List
from tensorflow.train import Example, Features, Feature

# The Data
image = tf.constant([ # this could also be a numpy array
    [0, 1, 2],
    [3, 4, 5],
    [6, 7, 8],
])
label = 0
class_name = "Class A"


# Wrap with Feature as a BytesList, FloatList, or Int64List
image_feature = Feature(
    bytes_list=BytesList(value=[
        tf.io.serialize_tensor(image).numpy(),
    ])
)
label_feature = Feature(
    int64_list=Int64List(value=[label]),
)
class_name_feature = Feature(
    bytes_list=BytesList(value=[
        class_name.encode()
    ])
)


# Create a Features dictionary
features = Features(feature={
    'image': image_feature,
    'label': label_feature,
    'class_name': class_name_feature,
})

# Wrap with Example
example = Example(features=features)

print(example)

查看标签内容

一旦所有内容都被编码为一个示例（Example），可以使用SerializeToString方法将其序列化。

函数封装

def make_example(image, label, class_name):
    image_feature = Feature(
        bytes_list=BytesList(value=[
            tf.io.serialize_tensor(image).numpy(),
        ])
    )
    label_feature = Feature(
        int64_list=Int64List(value=[
            label,
        ])
    )
    class_name_feature = Feature(
        bytes_list=BytesList(value=[
            class_name.encode(),
        ])
    )

    features = Features(feature={
        'image': image_feature,
        'label': label_feature,
        'class_name': class_name_feature,
    })
    
    example = Example(features=features)
    
    return example.SerializeToString()

函数使用如下：

example = make_example(
    image=np.array([[1, 2], [3, 4]]),
    label=1,
    class_name="Class B",
)

print(example)

小结

整个过程可能如下所示：

1. 使用tf.data.Dataset构建数据集。您可以使用from_generator或from_tensor_slices方法。
2. 通过使用make_example遍历数据集来序列化数据集。
3. 使用io.TFRecordWriter或data.TFRecordWriter将数据集写入TFRecords。

然而，请注意，如果要在数据集的map方法中使用make_example之类的函数，您需要首先使用tf.py_function对其进行包装，因为TensorFlow以图模式执行数据集变换。您可以编写类似以下的代码：

ds_bytes = ds.map(lambda image, label: tf.py_function(func=make_example, inp=[image, label], Tout=tf.string))

其他资料

API文档tf.data.Dataset | TensorFlow v2.13.0。