DNA序列(DNA Consensus String, ACM/ICPC Seoul 2006, UVa1368) rust解法

输入m个长度均为n的DNA序列,求一个DNA序列,到所有序列的总Hamming距离尽量小。两个等长字符串的Hamming距离等于字符不同的位置个数,例如,ACGT和GCGA的Hamming距离为2(左数第1, 4个字符不同)。

输入整数m和n(4≤m≤50,4≤n≤1000),以及m个长度为n的DNA序列(只包含字母A,C,G,T),输出到m个序列的Hamming距离和最小的DNA序列和对应的距离。如有多解,要求为字典序最小的解。例如,对于下面5个DNA序列,最优解为TAAGATAC。

TATGATAC

TAAGCTAC

AAAGATCC

TGAGATAC

TAAGATGT

解法

rust 复制代码
use std::{collections::HashMap, io};

fn main() {
    let mut grid: Vec<Vec<char>> = vec![];
    let mut buf = String::new();
    io::stdin().read_line(&mut buf).unwrap();
    let mut iter = buf.split_whitespace();
    let m: usize = iter.next().unwrap().parse().unwrap();
    let n: usize = iter.next().unwrap().parse().unwrap();

    for _i in 0..m {
        let mut buf = String::new();
        io::stdin().read_line(&mut buf).unwrap();
        let cs = buf.trim().chars().collect();
        grid.push(cs);
    }
    /*for s in &grid {
        let s: String = s.iter().collect();
        println!("{:?}", s);
    }*/
    let mut ans = String::new();
    for i in 0..n {
        let mut kv = HashMap::new();
        for j in 0..m {
            kv.entry(grid[j][i])
                .and_modify(|num| *num += 1)
                .or_insert(1);
        }
        let mut mc = (' ', 0);
        let mut cs: Vec<_> = kv.keys().collect();
        cs.sort();

        for k in cs {
            if kv.get(k).unwrap() > &mc.1 {
                mc = (*k, *kv.get(k).unwrap());
            }
        }
        ans.push(mc.0);
    }
    println!("{}", ans);
}
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