R语言【taxlist】——dissect_name()：将科学名的各个组分解析出来

ALittleHigh2024-01-30 1:07

Package taxlist version 0.2.4

Description

根据命名法的解析程度和特定角色，包含分类单元用法名称（学名）的字符串由不同部分组成。

因此，带有名称的字符串可以分解成这些部分，同时部分的数量可能表明了分类等级。

该方法是 strsplit() 的包装器，如果在参数【repaste】中指明的话，还可以重新粘贴名称组分。

Usage

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dissect_name(x, split = " ", fixed = TRUE, repaste, ...)

Arguments

参数【x】：一个包含分类名称的字符向量。

参数【split，fixed，...】：传递给 strsplit() 的参数。

参数【repaste】：一个整数向量，指示输出的名称的组分。

Value

一个字符矩阵，在输入向量中具有与名称相同数量的行。如果指定了reaste，那么输出将是一个字符向量。

Examples

++预备：十个变种名称：++

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sp_list <- subset(x = Easplist, subset = Level == "variety", slot = "relations")
sp_list <- accepted_name(sp_list)[c(1:10), "TaxonName"]

++直接解析名称：++

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dissect_name(sp_list)

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      [,1]          [,2]            [,3]   [,4]               
 [1,] "Euphorbia"   "inaequilatera" "var." "dentata"          
 [2,] "Oldenlandia" "corymbosa"     "var." "caespitosa"       
 [3,] "Pilea"       "usambarensis"  "var." "veronicifolia"    
 [4,] "Trifolium"   "semipilosum"   "var." "glabrescens"      
 [5,] "Pentas"      "lanceolata"    "var." "nemorosa"         
 [6,] "Stachys"     "aculeolata"    "var." "aculeolata"       
 [7,] "Pimpinella"  "oreophila"     "var." "kilimandscharica" 
 [8,] "Cyperus"     "denudatus"     "var." "lucenti-nigricans"
 [9,] "Achyranthes" "aspera"        "var." "sicula"           
[10,] "Digitaria"   "diagonalis"    "var." "uniglumis"

++解析名称，输出前两个组分：++

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dissect_name(sp_list, repaste = c(1:2))

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 [1] "Euphorbia inaequilatera" "Oldenlandia corymbosa"   "Pilea usambarensis"     
 [4] "Trifolium semipilosum"   "Pentas lanceolata"       "Stachys aculeolata"     
 [7] "Pimpinella oreophila"    "Cyperus denudatus"       "Achyranthes aspera"     
[10] "Digitaria diagonalis"