【R语言实战】聚类分析及可视化

小墨&晓末2024-03-11 15:43

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个人介绍: 研一｜统计学｜干货分享
擅长Python、Matlab、R等主流编程软件
累计十余项国家级比赛奖项，参与研究经费10w、40w级横向

文章目录

[1 系统聚类及可视化](#1 系统聚类及可视化)
[2 KMeans聚类及可视化](#2 KMeans聚类及可视化)

洛杉矶街区数据（LA.Neihborhoods.csv）这是美国普查局2000年的数据。一共有110个街区，15个变量。变量情况见下表。表中API为涉及学生成绩的Academic Performance Index的缩写。增加单位面积下的人口数（变量名density），试对修改后的数据按照income,age,homes,white和density的数据进行系统聚类和Kmeans聚类分析（分成5类），并根据所分类别和每个街区的经纬度，把各个类用不同的符号画图进行可视化。

1 系统聚类及可视化

运行代码：

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w=read.csv("E://mvstats5/data/LA.Neighborhoods.csv")#读入数据
w=data.frame(w,density=w$Population/w$Area)#增加人口密度变量
u=w[,c(1,2,5,6,11,16)]#选择变量
hw=hclust(dist(scale(u[,-1])), "ward.D2") #对标准化的数据做分层聚类, 聚类方法选的"ward.D2"
plot(hw,labels=u[,1],cex=0.6)#画树状图
id=identify(hw)#手工分成5份
rect.hclust(hw,5)

运行结果：

2 KMeans聚类及可视化

运行代码：

复制代码

a=kmeans(scale(u[,-1]),5);ppp=c(7,17,19,21)
plot(w[a$cluster==1,14:15],pch=1,col=1,xlim=c(-118.7,-118.2),ylim=c(33.73,34.32),main="Los Angeles")
for(i in 2:5){
  points(w[a$cluster==i,14:15],pch=ppp[i-1],col=2:5)
  legend("bottomleft",pch=c(1,ppp),paste("Cluster",1:4))
}

运行结果：