基于R语言BIOMOD2 及机器学习方法的物种分布模拟与案例分析

原文链接:基于R语言BIOMOD2 及机器学习方法的物种分布模拟与案例分析https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUzNTczMDMxMg==&mid=2247606139&idx=4&sn=f94ec30bfb5fa7ac0320403d49db3b66&chksm=fa821e9ccdf5978a44a9ba96f6e04a121c0bbf63beea0940b385011c0bf5be54c56993c1b61a&token=296806589&lang=zh_CN#rd第一:引入和理论基础

生态模型基础:生态模型的基本和物种分布模型(SDMs)的重要性。

biomod2:探讨biomod2的历史、发展和主要功能。

R语言重点工具入门:数据输入与输出、科学计算、地理数据分析、数据可视化等功能。

第二:数据获取与预处理

常见地球科学数据(数据特点与获取途径):

(1)物种分布数据;

(2)环境变量(站点数据、遥感数据)。

基于R语言的数据预处理:

(1)数据提取:根据需求批量提取相关数据;

(2)数据清洗:数据清洗的原则与方法;

(3)特征变量选择:通过相关性分析、主成分分析(PCA)等方法选择具有代表性的特征变量,提高模型效率。

第三: 模型的建立与评估

机器学习与R语言实践

(1)机器学习原理;(2)常见机器学习算法与流程

基于单一机器学习算法的物种分布特征模拟(以最大熵算法为例)。

biomod2程序包与使用:原理、构成

实际操作:构建第一个物种分布模型,包括选择模型类型和调整参数。

模型评估方法:通过ROC曲线、AUC值等方法评估模型的有效性和准确性。

第四: 模型优化与多模型集成

典型算法参数优化:对随机森林、最大熵等算法进行参数优化,提高模型性能。

集成方法:结合多个模型提高预测结果的稳定性和准确性。

物种分布特征预测: 基于单一模型与集成模型预测物种未来分布特征。

实战:参与者使用自己的数据或示例数据集,尝试实现多模型集成。

第五: 结果分析和案例研究

结果分析:物种分布特征、环境变量与物种分布关系、未来分布特征预测。

科学制图:栅格图、柱状图、降维结果图等。

案例研究:分析物种分布案例,如何应用学到的技能和知识。

相关推荐
爱吃泡芙的小白白2 小时前
环境数据多维关系探索利器:Pairs Plot 完全指南
python·信息可视化·数据分析·环境领域·pairs plot
砚边数影14 小时前
数据可视化入门:Matplotlib 基础语法与折线图绘制
数据库·信息可视化·matplotlib·数据可视化·kingbase·数据库平替用金仓·金仓数据库
jiang_changsheng20 小时前
环境管理工具全景图与深度对比
java·c语言·开发语言·c++·python·r语言
计算机学姐20 小时前
基于SpringBoot的民宿预定管理系统【三角色+个性化推荐算法+数据可视化统计】
java·vue.js·spring boot·mysql·信息可视化·intellij-idea·推荐算法
爱吃泡芙的小白白21 小时前
环境数据可视化利器:Hexbin Chart 全解析与应用实战
信息可视化·数据挖掘·数据分析·环境领域·hexbin chart
爱吃泡芙的小白白21 小时前
环境数据可视化利器:气泡图(Bubble Chart)全解析
信息可视化·数据挖掘·数据分析·气泡图·bubble chart·环境领域
JicasdC123asd1 天前
使用Faster R-CNN模型训练汽车品牌与型号检测数据集 改进C4结构 优化汽车识别系统 多类别检测 VOC格式
r语言·cnn·汽车
计算机学姐1 天前
基于SpringBoot的校园社团管理系统
java·vue.js·spring boot·后端·spring·信息可视化·推荐算法
数研小生1 天前
1688商品列表API:高效触达批发电商海量商品数据的技术方案
大数据·python·算法·信息可视化·json
沐墨染1 天前
Vue实战:自动化研判报告组件的设计与实现
前端·javascript·信息可视化·数据分析·自动化·vue