R语言实用技巧--用get函数配合dplyr包传参

使用场景,今天在做cellchat,需要提取一下几种细胞类型的id。目前的设置是这样。

R 复制代码
sce.all = seurat_obj
Idents(sce.all) = "CAFs"
celltype_sender=c("iCAF","myCAF")

如果正常写代码传参是这样

R 复制代码
sender_ids <- sce.all@meta.data %>% 
    filter(CAFs %in% celltype_sender) %>%
    rownames()

但是如果我想换一种细胞类型,CAFs就也要改,不够简洁。filter函数是不支持以下写法的,什么都筛选不出来

R 复制代码
celltype_sender_idents = "CAFs"
sender_ids <- sce.all@meta.data %>% 
    filter(celltype_sender_idents %in% celltype_sender) %>%
    rownames()

解决方案:

R 复制代码
sce.all = seurat_obj
Idents(sce.all) = "CAFs"
celltype_sender=c("iCAF","myCAF")
celltype_sender_idents = "CAFs"

sender_ids <- sce.all@meta.data %>% 
    filter(get(celltype_sender_idents) %in% celltype_sender) %>%
    rownames()

这样就可以在一开始把变量设置好,在后面优雅的传参了

相关推荐
jiushun_suanli19 小时前
FPGA(现场可编程门阵列)详解
经验分享·学习·fpga开发
虫洞没有虫21 小时前
Go语言学习笔记(二)
笔记·学习
AA陈超1 天前
ASC学习笔记0001:处理目标选择系统中当Actor拒绝目标确认时的调用
c++·笔记·学习·游戏·ue5·游戏引擎·虚幻
Solyn_HAN1 天前
Snakemake 从入门到实战:生信自动化工作流搭建指南
生物信息学·snakemake
AI研一研1 天前
如何快速学习知识、查找要点、把知识读“薄”、读“精”?
人工智能·学习
rannn_1111 天前
【Javaweb学习|黑马笔记|Day5】Web后端基础|java操作数据库
数据库·后端·学习·javaweb
AA陈超1 天前
ASC学习笔记0022:在不打算修改属性集时访问生成的属性集
c++·笔记·学习·ue5·虚幻引擎·unreal engine
HalvmånEver1 天前
Linux:基础开发工具(四)
linux·运维·服务器·开发语言·学习·makefile
q***78781 天前
Spring学习——新建module模块
java·学习·spring
Bin二叉1 天前
南京大学cpp复习——面向对象第一部分(构造函数,拷贝构造函数,析构函数,移动构造函数,友元)
c++·笔记·学习