谈数据之前,我们要先知道数据有哪几种类型。数据的维度,数据的频率、位置、分布(方差或标准差衡量)等。
接着就是数据的质量,数据挖掘着眼于要么是对数据质量问题的检测和纠正,要么是使用可以容忍低质量数据的算法。第一步对数据质量问题的检测和纠正,通常称作数据清理。
涉及测量误差的问题:噪声、伪像、偏置、精度和准确度。
同时涉及测量误差和数据收集的问题:离群点、遗漏值、重复数据。
如何处理缺失值?删除/估计缺失值/分析过程中忽略缺失值/用所有可能值(按概率加权)替换
非标准化数据:不同特征的值域差别过大。这会带来什么问题?
1,在计算不同样本之间的距离时,假如不标准化,可能造成对特征的重要程度估计的影响
2,忽略了真正的偏差
两类标准化方式:
1,Max-Min标准化。容易受极端值影响。
2,Z-score标准化。使用前提:高斯分布。
标准化是同类数据之间进行的。
值得一提的是基因/蛋白表达矩阵(行为样本,列为基因),需要去除batch的时候,是沿着列标准化,要对基因表达正则化则沿着行(有些基因天生表达差异大)
对于分类数据或非量化数据,可以用one-hot encoding。
总之,数据清洗分为以下几步:数据去噪,清除异常值,处理缺失值,删除重复,分类数据编码,数据标准化。先后顺序可能会影响最后结果。