MaxEnt模型进阶:基于R语言自动化与GIS空间建模的物种栖息地精准预测

生物多样性的空间分布规律及其对环境变化的响应机制,是生态学与地理学研究的前沿议题。在气候变化加剧和人类活动干扰的双重压力下,如何精准预测物种潜在分布范围、识别关键环境驱动因子,已成为制定生物保护策略的核心科学问题。物种分布模型(Species Distribution Models, SDMs)作为连接生态数据与空间预测的桥梁,其方法学创新与跨学科技术融合正推动该领域向更高精度、更强解释力的方向发展。

最大熵模型(MaxEnt)因其在小样本数据下的稳健性和对复杂环境关系的捕捉能力,成为SDMs中应用最广泛的工具之一。然而,现有研究多聚焦于基础建模流程,对多源异构数据的自动化处理模型参数的智能优化空间结果的可解释性分析 等关键环节缺乏系统性指导,导致模型应用常陷入"黑箱化"困境。为此,以"理论解构-技术融合-实践赋能 "为脉络,整合R语言计算生态ArcGIS空间分析MaxEnt模型算法,构建从数据获取到科学决策的全链条研究方法体系。

【内容简介】:

第一章:理论篇:以问题导入的方式,深入掌握原理基础

  1. 什么是MaxEnt模型?
  2. MaxEnt模型的原理是什么?有哪些用途?
  3. MaxEnt运行需要哪些输入文件?注意那些事项?
  4. 融合R语言的MaxEnt模型的优势?

第二章:常用数据检索与R语言自动化下载及可视化方法

  1. 常用数据下载网站(包括:气候、土壤、水文等,GBIF)
  2. 数据获取方法
  3. 1)手动下载
  4. 2)R语言命令行自动下载与可视化方法

第三章:R语言数据清洗与特征变量筛选

  1. R、Rstudio安装
  2. 软件常用功能讲解
  3. 数据清洗的原理与实操练习
  4. (清除数据库中缺少经纬度的数据、重复的数据)
  5. 利用相关性分析进行特征变量选择与实操练习

第四章:基于ArcGIS、R数据处理与进阶

  1. ArcGIS安装
  2. ArcGIS常用功能讲解与实践
  3. 利用ArcGIS进行模型数据准备
  4. 进阶:基于R语言的数据准备

第五章:基于Maxent的物种分布建模与预测

  1. Java、MaxEnt安装
  2. 模型界面说明
  3. 数据输入与变量设置讲解
  4. 输出结果分析

第六章:基于R语言的模型参数优化

  1. 敏感参数讲解
  2. 参数优化原理与实操练习
  3. 模型评价

第七章:物种分布模型结果分析与论文写作

  1. 物种分布特征分析
  2. 环境因素对物种分布的影响分析与制图
  3. 论文写作制图
相关推荐
invincible_Tang3 小时前
R格式 (15届B) 高精度
开发语言·算法·r语言
KY_chenzhao5 小时前
基于R语言与MaxEnt的物种分布建模全流程解析:从算法优化到科研制图实战
r语言·maxent·气候变化·物种分布
tRNA做科研5 小时前
通过Bioconductor/BiocManager安装生物r包详解(问题汇总)
开发语言·r语言·生物信息学·bioconductor·biocmanager
Tiger Z5 小时前
R 语言科研绘图 --- 韦恩图-汇总
开发语言·程序人生·r语言·贴图
Biomamba生信基地1 天前
R语言入门课| 04 R语言基本函数
开发语言·r语言·生信
十三画者1 天前
【工具】BioPred一个用于精准医疗中生物标志物分析的 R 软件包
数据挖掘·数据分析·r语言·数据可视化
小艳加油2 天前
MaxEnt物种分布建模全流程;R+ArcGIS+MaxEnt模型物种分布模拟、参数优化方法、结果分析制图与论文写作
arcgis·r语言·物种分布模拟·maxent模型
预测模型的开发与应用研究2 天前
R语言实现轨迹分析--traj和lcmm包体会
机器学习·数据分析·r语言
Hefin_H4 天前
怎么把 GitHub 中的 R 包项目手动安装到 conda 环境中?
r语言·github·conda