081B 基于R包-Ecospat的生态位重叠分化迁移分析与可视化制图(单物种和多物种版本)【2027】

基于R包-Ecospat的生态位重叠-分化-变迁分析与可视化制图(单物种和多物种版本)【2027】

本教程旨在通过系统的培训学习,学员可以掌握数据的获取处理、可视化制图、基础写作等。课程内容培训针对0基础学员,所有内容均为中文实操演示,可以查看每一步操作;每章节内容无固定时长,知识点讲完为止。

课程特点介绍:

该套课程特点:(1)该"Ecospat"课程支持与maxent、Biomod2、GARP等模型数据的关联分析,增加论文数据,降低论文重复率;(2)提供约3500字定制写作Word模板,降低分析与写作难度;(3)Ecospat新增单物种多时期多情景数据分析,与多物种之间分析的内容;(4)包含Schoener_D、Hellinger_I、Centroid_Shift、Centroid_Shift_Axis1、Centroid_Shift_Axis2、Equivalency_Pvalue Similarity_Pvalue等结果指标;(5)支持自定义绘图(参数可调),生态位重叠图自定义参数(是否显示-背景点、背景点质心、样本点、颜色、线条、字号等),个人图表差异性展示,所有图自动导出PDF+tif矢量图,支持投稿和二次编辑排版;(6)详细的结果解读和写作思路参考资料指导。

课程主要内容:

1.视频附带资料下载和密码

专题一相关软件安装和参数配置

1.R、Rtools软件和工具包安装

2.环境变量配置与测试

3.R包安装和报错说明

专题二 单一物种不同时期气候情景下的生态位重叠、分化、变迁方向距离分析与可视化

  1. PCA分析与可视化制图
  2. 等价性检验与相似性检验直方图
  3. 生态位重叠分化变迁动态图
  4. 相关指标计算与解读(Schoener_D、Hellinger_I、Centroid_Shift、Centroid_Shift_Axis1、Centroid_Shift_Axis2、Equivalency_Pvalue Similarity_Pvalue)

该专题通过PCA分析揭示驱动物种生态位分化的主要环境梯度,分析单一物种在不同时期和气候情景下的生态位重叠指数、生态位分化指数、生态位变迁方向与距离指数分析与可视化制图。生态位变迁≠适宜区质心迁移,课程解释概念区别。

部分结果草图展示:

|-----------|--------|------------|-------------|----------------|----------------------|----------------------|--------------------|-------------------|
| Period | SSP | Schoener_D | Hellinger_I | Centroid_Shift | Centroid_Shift_Axis1 | Centroid_Shift_Axis2 | Equivalency_Pvalue | Similarity_Pvalue |
| 2021-2040 | ssp126 | 0.758 | 0.8163 | 0.6868 | -0.6811 | -0.0879 | 0.0099 | 0.0594 |
| 2021-2040 | ssp245 | 0.7317 | 0.7831 | 0.7569 | -0.7517 | -0.0886 | 0.0099 | 0.0495 |
| 2041-2060 | ssp126 | 0.7572 | 0.8065 | 0.7154 | -0.6976 | -0.1583 | 0.0099 | 0.0396 |
| 2041-2060 | ssp245 | 0.6805 | 0.7387 | 0.9928 | -0.9872 | -0.1048 | 0.0099 | 0.0297 |
| 2061-2080 | ssp126 | 0.6941 | 0.7655 | 0.9268 | -0.9205 | -0.1083 | 0.0099 | 0.0495 |
| 2061-2080 | ssp245 | 0.6706 | 0.7181 | 0.9926 | -0.9727 | -0.1975 | 0.0099 | 0.0297 |
| 2081-2100 | ssp126 | 0.6677 | 0.7428 | 1.0368 | -1.0311 | -0.108 | 0.0099 | 0.0297 |
| 2081-2100 | ssp245 | 0.6781 | 0.7194 | 1.1264 | -1.1039 | -0.2241 | 0.0099 | 0.0396 |

专题三 多物种生态位重叠、分化、变迁分析与可视化制图

  1. 等价性检验与相似性检验直方图
  2. 生态位重叠分化变迁动态图
  3. 相关指标计算与解读

该专题主要用于多物种的生态位重叠、生态位分化。生态位变迁计算与结果可视化分析,例如A物种和B物种的生态位相似度分析与绘图。

专题四 写作思路指导(带写作参考Word 文字版)

该专题提供写作参考Word文档约3500字(6页),包含该部分的实验方法,结果展示与分析,结论和讨论部分。

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