ezygene-多种算法计算免疫评分

免疫评分的方法有很多,如CIBERSORT_ABS;CIBERSORT;quantiseq;mcpcounter;xcell;EPIC;TME;immnue_28,immnue_13,ESITIMATE

其中CIBERSORT_ABS,CIBERSORT,mcpcounter,xcell,quantiseq方法是通过R语言的IOBR包预测的细胞丰度,EPIC方法,是通过R语言的EPIC包预测的,TME方法是通过R语言的TMEscore包预测的TME评分,immnue_28方法是通过ssGSEA的方法对pmid:28052254文章中获得的28个细胞的特征基因计算的评分,immnue_13方法是通过ssGSEA的方法对pmid:28428277文章中获得的13个细胞的特征基因计算的评分。ESITIMATE使用R语言的estimate包预测的免疫评分。

https://www.ezygene.com/tool/calculating_immune_infiltratio_visualization

这里可以针对已经建好库的表达谱进行进行测试,免疫浸润的方法有很多种,可以单选也可以多选,我一般是直接全部选上,到时候想用啥用啥?当然选的越多,运行的越慢。

当然也可以选择自己上传数据集

直接选择就可以了,这操作不比你写代码更加酸爽!

最有意思的是,他提供了两种有意思的可视化的方法

第一种比较可视化

相关性可视化

选来选去都是参数不停的在改动,一个工具的强大,就在于,他能完成什么样的工作量

相关推荐
ThsPool几秒前
【遥感学习整理 02】ENVI遥感图像处理基础:从数据读取到遥感信息产品
图像处理·人工智能·学习
非凸科技10 分钟前
非凸智能APP
人工智能
土星云SaturnCloud23 分钟前
抽水蓄能设备智慧运营:基于土星云边缘计算实现机组全生命周期预测性维护
服务器·人工智能·ai·边缘计算
江畔柳前堤24 分钟前
系统的本质——从LTI系统到神经网络
人工智能·深度学习·神经网络·机器学习·计算机视觉·数据挖掘·语音识别
HackTwoHub38 分钟前
轻量化AI渗透武器库|ARTEX自主攻防系统、资产梳理、漏洞挖掘、链路分析全流程智能化落地
人工智能·安全·web安全·网络安全·系统安全·网络攻击模型·安全架构
中电金信1 小时前
WAIC 2026媒体聚焦:中电金信的AI工程化思考与实践
人工智能
冬奇Lab1 小时前
码库知识库系列(03):代码 Embedding 策略——原始代码反而比注释增强更好
人工智能
冬奇Lab1 小时前
开源项目第172期:agentOS — 以库的形式给 AI Agent 一个操作系统,冷启动 92x 更快、内存 47x 更少
人工智能·开源·agent
大橙子打游戏1 小时前
make-goal:把长期 AI 任务从聊天记录里解放出来
人工智能
华盈生物1 小时前
AI+病理:从切片到数据,空间多模态解析肿瘤微环境
人工智能·单细胞测序·空间单细胞蛋白组·单细胞组织原位空间蛋白组学·组织原位空间蛋白组学·超多重蛋白成像·ai+病理