ezygene-多种算法计算免疫评分

免疫评分的方法有很多,如CIBERSORT_ABS;CIBERSORT;quantiseq;mcpcounter;xcell;EPIC;TME;immnue_28,immnue_13,ESITIMATE

其中CIBERSORT_ABS,CIBERSORT,mcpcounter,xcell,quantiseq方法是通过R语言的IOBR包预测的细胞丰度,EPIC方法,是通过R语言的EPIC包预测的,TME方法是通过R语言的TMEscore包预测的TME评分,immnue_28方法是通过ssGSEA的方法对pmid:28052254文章中获得的28个细胞的特征基因计算的评分,immnue_13方法是通过ssGSEA的方法对pmid:28428277文章中获得的13个细胞的特征基因计算的评分。ESITIMATE使用R语言的estimate包预测的免疫评分。

https://www.ezygene.com/tool/calculating_immune_infiltratio_visualization

这里可以针对已经建好库的表达谱进行进行测试,免疫浸润的方法有很多种,可以单选也可以多选,我一般是直接全部选上,到时候想用啥用啥?当然选的越多,运行的越慢。

当然也可以选择自己上传数据集

直接选择就可以了,这操作不比你写代码更加酸爽!

最有意思的是,他提供了两种有意思的可视化的方法

第一种比较可视化

相关性可视化

选来选去都是参数不停的在改动,一个工具的强大,就在于,他能完成什么样的工作量

相关推荐
海宇服务1 小时前
零信任架构实战:基于海宇天远入职背调报告构建自动化微服务准入网关
人工智能·微服务·架构·自动化
外域速览1 小时前
亚马逊600亿美元押注高通AI芯片
人工智能
7177771 小时前
开源代码审计平台推荐:Gitee 在企业代码审计流程中的定位与选型建议
人工智能·gitee
大模型任我行2 小时前
Meta:AI让推荐系统自动化持续优化
人工智能·语言模型·自然语言处理·论文笔记
wordbaby2 小时前
TF-IDF 是什么?从零理解检索算法的核心直觉
人工智能
七爷数码AI2 小时前
语音合成工具提升声音自然度的七步闭环调优方案
人工智能
智驭未来掌门人2 小时前
DeepSeek Harness 踩坑指南(基于大模型网关)
人工智能
Geek-Chow2 小时前
DeepSeek Harness 是什么:定义、边界与生态位置
人工智能
武子康2 小时前
小智的音频队列满了:丢旧帧、拒新包与播放延迟
人工智能·llm·agent
代码方舟2 小时前
高并发架构实战:基于天远手机空号检测V即时版构建自动化号码过滤网关
人工智能·智能手机·架构·自动化